Protein–RNA interactions for Protein: Q5M9N0

CCDC158, Coiled-coil domain-containing protein 158, humanhuman

Predictions only

Length 1,113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC158Q5M9N0 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC158Q5M9N0 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC158Q5M9N0 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC158Q5M9N0 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC158Q5M9N0 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC158Q5M9N0 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC158Q5M9N0 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC158Q5M9N0 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC158Q5M9N0 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC158Q5M9N0 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC158Q5M9N0 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC158Q5M9N0 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC158Q5M9N0 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC158Q5M9N0 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC158Q5M9N0 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC158Q5M9N0 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC158Q5M9N0 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC158Q5M9N0 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC158Q5M9N0 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC158Q5M9N0 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC158Q5M9N0 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC158Q5M9N0 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC158Q5M9N0 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC158Q5M9N0 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC158Q5M9N0 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC158Q5M9N0 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC158Q5M9N0 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC158Q5M9N0 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC158Q5M9N0 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC158Q5M9N0 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC158Q5M9N0 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC158Q5M9N0 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC158Q5M9N0 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC158Q5M9N0 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC158Q5M9N0 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC158Q5M9N0 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC158Q5M9N0 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC158Q5M9N0 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC158Q5M9N0 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC158Q5M9N0 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC158Q5M9N0 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC158Q5M9N0 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC158Q5M9N0 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC158Q5M9N0 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC158Q5M9N0 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC158Q5M9N0 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC158Q5M9N0 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC158Q5M9N0 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC158Q5M9N0 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC158Q5M9N0 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC158Q5M9N0 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC158Q5M9N0 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC158Q5M9N0 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC158Q5M9N0 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC158Q5M9N0 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC158Q5M9N0 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC158Q5M9N0 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC158Q5M9N0 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC158Q5M9N0 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC158Q5M9N0 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC158Q5M9N0 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC158Q5M9N0 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC158Q5M9N0 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC158Q5M9N0 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC158Q5M9N0 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC158Q5M9N0 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC158Q5M9N0 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC158Q5M9N0 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC158Q5M9N0 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC158Q5M9N0 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC158Q5M9N0 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC158Q5M9N0 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC158Q5M9N0 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC158Q5M9N0 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC158Q5M9N0 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC158Q5M9N0 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC158Q5M9N0 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC158Q5M9N0 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC158Q5M9N0 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC158Q5M9N0 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC158Q5M9N0 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC158Q5M9N0 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC158Q5M9N0 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC158Q5M9N0 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC158Q5M9N0 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC158Q5M9N0 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC158Q5M9N0 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC158Q5M9N0 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC158Q5M9N0 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC158Q5M9N0 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC158Q5M9N0 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC158Q5M9N0 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC158Q5M9N0 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC158Q5M9N0 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC158Q5M9N0 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC158Q5M9N0 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC158Q5M9N0 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC158Q5M9N0 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC158Q5M9N0 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC158Q5M9N0 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms