Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVS0

HABP4, Intracellular hyaluronan-binding protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HABP4Q5JVS0 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HABP4Q5JVS0 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HABP4Q5JVS0 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HABP4Q5JVS0 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HABP4Q5JVS0 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HABP4Q5JVS0 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HABP4Q5JVS0 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
HABP4Q5JVS0 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HABP4Q5JVS0 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HABP4Q5JVS0 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HABP4Q5JVS0 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HABP4Q5JVS0 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HABP4Q5JVS0 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HABP4Q5JVS0 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HABP4Q5JVS0 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HABP4Q5JVS0 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HABP4Q5JVS0 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HABP4Q5JVS0 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HABP4Q5JVS0 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HABP4Q5JVS0 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HABP4Q5JVS0 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HABP4Q5JVS0 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HABP4Q5JVS0 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HABP4Q5JVS0 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HABP4Q5JVS0 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HABP4Q5JVS0 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HABP4Q5JVS0 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HABP4Q5JVS0 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HABP4Q5JVS0 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HABP4Q5JVS0 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HABP4Q5JVS0 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HABP4Q5JVS0 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HABP4Q5JVS0 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HABP4Q5JVS0 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HABP4Q5JVS0 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HABP4Q5JVS0 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HABP4Q5JVS0 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HABP4Q5JVS0 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HABP4Q5JVS0 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HABP4Q5JVS0 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HABP4Q5JVS0 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HABP4Q5JVS0 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
HABP4Q5JVS0 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
HABP4Q5JVS0 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
HABP4Q5JVS0 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HABP4Q5JVS0 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HABP4Q5JVS0 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HABP4Q5JVS0 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
HABP4Q5JVS0 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HABP4Q5JVS0 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
HABP4Q5JVS0 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HABP4Q5JVS0 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HABP4Q5JVS0 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HABP4Q5JVS0 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HABP4Q5JVS0 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HABP4Q5JVS0 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HABP4Q5JVS0 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HABP4Q5JVS0 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HABP4Q5JVS0 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HABP4Q5JVS0 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HABP4Q5JVS0 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HABP4Q5JVS0 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HABP4Q5JVS0 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HABP4Q5JVS0 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HABP4Q5JVS0 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HABP4Q5JVS0 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
HABP4Q5JVS0 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HABP4Q5JVS0 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
HABP4Q5JVS0 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HABP4Q5JVS0 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HABP4Q5JVS0 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HABP4Q5JVS0 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HABP4Q5JVS0 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HABP4Q5JVS0 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HABP4Q5JVS0 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HABP4Q5JVS0 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HABP4Q5JVS0 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HABP4Q5JVS0 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HABP4Q5JVS0 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HABP4Q5JVS0 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HABP4Q5JVS0 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HABP4Q5JVS0 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
HABP4Q5JVS0 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HABP4Q5JVS0 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HABP4Q5JVS0 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HABP4Q5JVS0 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HABP4Q5JVS0 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HABP4Q5JVS0 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HABP4Q5JVS0 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HABP4Q5JVS0 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HABP4Q5JVS0 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HABP4Q5JVS0 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HABP4Q5JVS0 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HABP4Q5JVS0 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
HABP4Q5JVS0 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HABP4Q5JVS0 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HABP4Q5JVS0 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HABP4Q5JVS0 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HABP4Q5JVS0 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HABP4Q5JVS0 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms