Protein–RNA interactions for Protein: Q587J8

KHDC3L, KHDC3-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KHDC3LQ587J8 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KHDC3LQ587J8 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KHDC3LQ587J8 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KHDC3LQ587J8 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KHDC3LQ587J8 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KHDC3LQ587J8 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KHDC3LQ587J8 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KHDC3LQ587J8 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KHDC3LQ587J8 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KHDC3LQ587J8 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KHDC3LQ587J8 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KHDC3LQ587J8 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KHDC3LQ587J8 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KHDC3LQ587J8 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
KHDC3LQ587J8 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KHDC3LQ587J8 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
KHDC3LQ587J8 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KHDC3LQ587J8 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KHDC3LQ587J8 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KHDC3LQ587J8 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KHDC3LQ587J8 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KHDC3LQ587J8 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KHDC3LQ587J8 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KHDC3LQ587J8 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KHDC3LQ587J8 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KHDC3LQ587J8 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KHDC3LQ587J8 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KHDC3LQ587J8 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KHDC3LQ587J8 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KHDC3LQ587J8 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KHDC3LQ587J8 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KHDC3LQ587J8 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KHDC3LQ587J8 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KHDC3LQ587J8 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KHDC3LQ587J8 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KHDC3LQ587J8 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KHDC3LQ587J8 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KHDC3LQ587J8 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KHDC3LQ587J8 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KHDC3LQ587J8 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KHDC3LQ587J8 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KHDC3LQ587J8 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KHDC3LQ587J8 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
KHDC3LQ587J8 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KHDC3LQ587J8 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KHDC3LQ587J8 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KHDC3LQ587J8 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KHDC3LQ587J8 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KHDC3LQ587J8 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KHDC3LQ587J8 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KHDC3LQ587J8 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KHDC3LQ587J8 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KHDC3LQ587J8 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KHDC3LQ587J8 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KHDC3LQ587J8 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KHDC3LQ587J8 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
KHDC3LQ587J8 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KHDC3LQ587J8 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KHDC3LQ587J8 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KHDC3LQ587J8 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KHDC3LQ587J8 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
KHDC3LQ587J8 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KHDC3LQ587J8 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KHDC3LQ587J8 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KHDC3LQ587J8 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KHDC3LQ587J8 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
KHDC3LQ587J8 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KHDC3LQ587J8 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KHDC3LQ587J8 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KHDC3LQ587J8 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KHDC3LQ587J8 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KHDC3LQ587J8 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KHDC3LQ587J8 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KHDC3LQ587J8 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KHDC3LQ587J8 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KHDC3LQ587J8 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KHDC3LQ587J8 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KHDC3LQ587J8 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KHDC3LQ587J8 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KHDC3LQ587J8 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KHDC3LQ587J8 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KHDC3LQ587J8 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KHDC3LQ587J8 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KHDC3LQ587J8 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KHDC3LQ587J8 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
KHDC3LQ587J8 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KHDC3LQ587J8 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KHDC3LQ587J8 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KHDC3LQ587J8 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KHDC3LQ587J8 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KHDC3LQ587J8 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KHDC3LQ587J8 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KHDC3LQ587J8 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KHDC3LQ587J8 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KHDC3LQ587J8 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KHDC3LQ587J8 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KHDC3LQ587J8 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KHDC3LQ587J8 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KHDC3LQ587J8 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KHDC3LQ587J8 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms