Protein–RNA interactions for Protein: Q53GT1

KLHL22, Kelch-like protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL22Q53GT1 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL22Q53GT1 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL22Q53GT1 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL22Q53GT1 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL22Q53GT1 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL22Q53GT1 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL22Q53GT1 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL22Q53GT1 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL22Q53GT1 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL22Q53GT1 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL22Q53GT1 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL22Q53GT1 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL22Q53GT1 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL22Q53GT1 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL22Q53GT1 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL22Q53GT1 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL22Q53GT1 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL22Q53GT1 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL22Q53GT1 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL22Q53GT1 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL22Q53GT1 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL22Q53GT1 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL22Q53GT1 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL22Q53GT1 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL22Q53GT1 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL22Q53GT1 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL22Q53GT1 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL22Q53GT1 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL22Q53GT1 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL22Q53GT1 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL22Q53GT1 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL22Q53GT1 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL22Q53GT1 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL22Q53GT1 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL22Q53GT1 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL22Q53GT1 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL22Q53GT1 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL22Q53GT1 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL22Q53GT1 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL22Q53GT1 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL22Q53GT1 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL22Q53GT1 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL22Q53GT1 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL22Q53GT1 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL22Q53GT1 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL22Q53GT1 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL22Q53GT1 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL22Q53GT1 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL22Q53GT1 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL22Q53GT1 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL22Q53GT1 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL22Q53GT1 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL22Q53GT1 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL22Q53GT1 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL22Q53GT1 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL22Q53GT1 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL22Q53GT1 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL22Q53GT1 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL22Q53GT1 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL22Q53GT1 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL22Q53GT1 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL22Q53GT1 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL22Q53GT1 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL22Q53GT1 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL22Q53GT1 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL22Q53GT1 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL22Q53GT1 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL22Q53GT1 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL22Q53GT1 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL22Q53GT1 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL22Q53GT1 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL22Q53GT1 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL22Q53GT1 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL22Q53GT1 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL22Q53GT1 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL22Q53GT1 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL22Q53GT1 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL22Q53GT1 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL22Q53GT1 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
KLHL22Q53GT1 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
KLHL22Q53GT1 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
KLHL22Q53GT1 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
KLHL22Q53GT1 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
KLHL22Q53GT1 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
KLHL22Q53GT1 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
KLHL22Q53GT1 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
KLHL22Q53GT1 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
KLHL22Q53GT1 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
KLHL22Q53GT1 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL22Q53GT1 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL22Q53GT1 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL22Q53GT1 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL22Q53GT1 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL22Q53GT1 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL22Q53GT1 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL22Q53GT1 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL22Q53GT1 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL22Q53GT1 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL22Q53GT1 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL22Q53GT1 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127 ms