Protein–RNA interactions for Protein: Q3C1V8

BSX, Brain-specific homeobox protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BSXQ3C1V8 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BSXQ3C1V8 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BSXQ3C1V8 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BSXQ3C1V8 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BSXQ3C1V8 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
BSXQ3C1V8 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BSXQ3C1V8 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BSXQ3C1V8 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BSXQ3C1V8 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
BSXQ3C1V8 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BSXQ3C1V8 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BSXQ3C1V8 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BSXQ3C1V8 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BSXQ3C1V8 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BSXQ3C1V8 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BSXQ3C1V8 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BSXQ3C1V8 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BSXQ3C1V8 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BSXQ3C1V8 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BSXQ3C1V8 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BSXQ3C1V8 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BSXQ3C1V8 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BSXQ3C1V8 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BSXQ3C1V8 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BSXQ3C1V8 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BSXQ3C1V8 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BSXQ3C1V8 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BSXQ3C1V8 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BSXQ3C1V8 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BSXQ3C1V8 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
BSXQ3C1V8 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BSXQ3C1V8 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BSXQ3C1V8 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BSXQ3C1V8 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BSXQ3C1V8 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BSXQ3C1V8 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BSXQ3C1V8 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BSXQ3C1V8 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BSXQ3C1V8 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BSXQ3C1V8 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BSXQ3C1V8 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BSXQ3C1V8 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BSXQ3C1V8 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BSXQ3C1V8 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BSXQ3C1V8 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BSXQ3C1V8 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BSXQ3C1V8 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BSXQ3C1V8 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BSXQ3C1V8 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BSXQ3C1V8 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BSXQ3C1V8 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BSXQ3C1V8 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BSXQ3C1V8 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BSXQ3C1V8 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BSXQ3C1V8 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BSXQ3C1V8 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BSXQ3C1V8 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BSXQ3C1V8 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BSXQ3C1V8 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BSXQ3C1V8 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BSXQ3C1V8 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BSXQ3C1V8 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BSXQ3C1V8 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BSXQ3C1V8 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BSXQ3C1V8 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BSXQ3C1V8 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BSXQ3C1V8 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BSXQ3C1V8 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BSXQ3C1V8 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BSXQ3C1V8 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BSXQ3C1V8 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BSXQ3C1V8 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BSXQ3C1V8 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BSXQ3C1V8 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BSXQ3C1V8 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BSXQ3C1V8 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BSXQ3C1V8 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
BSXQ3C1V8 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
BSXQ3C1V8 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
BSXQ3C1V8 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
BSXQ3C1V8 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
BSXQ3C1V8 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BSXQ3C1V8 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BSXQ3C1V8 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BSXQ3C1V8 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BSXQ3C1V8 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BSXQ3C1V8 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BSXQ3C1V8 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BSXQ3C1V8 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BSXQ3C1V8 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BSXQ3C1V8 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BSXQ3C1V8 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BSXQ3C1V8 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
BSXQ3C1V8 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
BSXQ3C1V8 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BSXQ3C1V8 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BSXQ3C1V8 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BSXQ3C1V8 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BSXQ3C1V8 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BSXQ3C1V8 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms