Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDO1Q16878 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDO1Q16878 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDO1Q16878 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDO1Q16878 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDO1Q16878 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDO1Q16878 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDO1Q16878 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDO1Q16878 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDO1Q16878 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDO1Q16878 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDO1Q16878 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDO1Q16878 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDO1Q16878 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDO1Q16878 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDO1Q16878 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDO1Q16878 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDO1Q16878 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDO1Q16878 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDO1Q16878 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDO1Q16878 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDO1Q16878 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDO1Q16878 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDO1Q16878 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDO1Q16878 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDO1Q16878 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDO1Q16878 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDO1Q16878 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDO1Q16878 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDO1Q16878 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDO1Q16878 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDO1Q16878 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDO1Q16878 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDO1Q16878 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDO1Q16878 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDO1Q16878 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDO1Q16878 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDO1Q16878 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDO1Q16878 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDO1Q16878 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDO1Q16878 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDO1Q16878 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDO1Q16878 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDO1Q16878 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDO1Q16878 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDO1Q16878 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDO1Q16878 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDO1Q16878 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDO1Q16878 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDO1Q16878 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDO1Q16878 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDO1Q16878 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CDO1Q16878 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDO1Q16878 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CDO1Q16878 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDO1Q16878 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDO1Q16878 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDO1Q16878 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDO1Q16878 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDO1Q16878 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDO1Q16878 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDO1Q16878 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDO1Q16878 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDO1Q16878 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDO1Q16878 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDO1Q16878 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDO1Q16878 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDO1Q16878 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDO1Q16878 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDO1Q16878 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDO1Q16878 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDO1Q16878 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDO1Q16878 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDO1Q16878 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDO1Q16878 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CDO1Q16878 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDO1Q16878 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CDO1Q16878 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDO1Q16878 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDO1Q16878 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDO1Q16878 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDO1Q16878 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDO1Q16878 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDO1Q16878 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDO1Q16878 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDO1Q16878 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDO1Q16878 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDO1Q16878 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDO1Q16878 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDO1Q16878 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDO1Q16878 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDO1Q16878 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDO1Q16878 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDO1Q16878 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDO1Q16878 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDO1Q16878 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDO1Q16878 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDO1Q16878 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDO1Q16878 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDO1Q16878 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms