Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CTF1Q16619 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CTF1Q16619 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CTF1Q16619 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CTF1Q16619 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CTF1Q16619 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CTF1Q16619 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CTF1Q16619 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CTF1Q16619 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CTF1Q16619 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CTF1Q16619 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CTF1Q16619 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CTF1Q16619 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CTF1Q16619 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CTF1Q16619 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CTF1Q16619 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
CTF1Q16619 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
CTF1Q16619 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
CTF1Q16619 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CTF1Q16619 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CTF1Q16619 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CTF1Q16619 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CTF1Q16619 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CTF1Q16619 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CTF1Q16619 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CTF1Q16619 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CTF1Q16619 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CTF1Q16619 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CTF1Q16619 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CTF1Q16619 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CTF1Q16619 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CTF1Q16619 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CTF1Q16619 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CTF1Q16619 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CTF1Q16619 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CTF1Q16619 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CTF1Q16619 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CTF1Q16619 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTF1Q16619 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CTF1Q16619 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTF1Q16619 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTF1Q16619 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTF1Q16619 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTF1Q16619 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTF1Q16619 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTF1Q16619 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTF1Q16619 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTF1Q16619 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTF1Q16619 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTF1Q16619 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTF1Q16619 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTF1Q16619 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CTF1Q16619 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CTF1Q16619 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CTF1Q16619 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTF1Q16619 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTF1Q16619 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTF1Q16619 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTF1Q16619 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTF1Q16619 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTF1Q16619 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTF1Q16619 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTF1Q16619 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTF1Q16619 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTF1Q16619 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTF1Q16619 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTF1Q16619 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTF1Q16619 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTF1Q16619 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTF1Q16619 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTF1Q16619 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTF1Q16619 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTF1Q16619 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTF1Q16619 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTF1Q16619 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTF1Q16619 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTF1Q16619 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTF1Q16619 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTF1Q16619 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CTF1Q16619 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTF1Q16619 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTF1Q16619 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTF1Q16619 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTF1Q16619 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTF1Q16619 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTF1Q16619 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTF1Q16619 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTF1Q16619 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTF1Q16619 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTF1Q16619 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTF1Q16619 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTF1Q16619 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTF1Q16619 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTF1Q16619 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTF1Q16619 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTF1Q16619 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTF1Q16619 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTF1Q16619 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTF1Q16619 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTF1Q16619 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms