Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ECM1Q16610 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ECM1Q16610 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ECM1Q16610 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ECM1Q16610 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ECM1Q16610 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ECM1Q16610 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ECM1Q16610 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ECM1Q16610 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ECM1Q16610 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ECM1Q16610 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ECM1Q16610 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ECM1Q16610 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ECM1Q16610 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ECM1Q16610 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ECM1Q16610 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ECM1Q16610 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ECM1Q16610 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ECM1Q16610 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ECM1Q16610 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ECM1Q16610 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ECM1Q16610 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ECM1Q16610 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ECM1Q16610 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ECM1Q16610 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ECM1Q16610 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ECM1Q16610 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ECM1Q16610 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ECM1Q16610 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ECM1Q16610 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ECM1Q16610 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ECM1Q16610 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ECM1Q16610 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ECM1Q16610 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ECM1Q16610 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ECM1Q16610 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ECM1Q16610 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ECM1Q16610 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ECM1Q16610 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ECM1Q16610 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ECM1Q16610 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ECM1Q16610 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ECM1Q16610 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ECM1Q16610 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ECM1Q16610 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ECM1Q16610 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ECM1Q16610 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ECM1Q16610 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ECM1Q16610 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ECM1Q16610 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ECM1Q16610 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ECM1Q16610 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ECM1Q16610 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ECM1Q16610 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ECM1Q16610 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ECM1Q16610 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ECM1Q16610 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ECM1Q16610 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ECM1Q16610 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ECM1Q16610 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ECM1Q16610 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ECM1Q16610 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ECM1Q16610 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ECM1Q16610 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ECM1Q16610 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ECM1Q16610 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ECM1Q16610 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ECM1Q16610 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ECM1Q16610 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ECM1Q16610 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ECM1Q16610 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ECM1Q16610 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ECM1Q16610 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ECM1Q16610 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ECM1Q16610 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ECM1Q16610 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ECM1Q16610 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ECM1Q16610 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ECM1Q16610 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ECM1Q16610 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ECM1Q16610 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ECM1Q16610 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ECM1Q16610 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ECM1Q16610 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ECM1Q16610 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ECM1Q16610 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ECM1Q16610 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ECM1Q16610 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ECM1Q16610 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ECM1Q16610 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ECM1Q16610 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ECM1Q16610 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ECM1Q16610 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ECM1Q16610 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ECM1Q16610 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ECM1Q16610 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ECM1Q16610 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ECM1Q16610 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ECM1Q16610 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ECM1Q16610 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
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