Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CNGA3Q16281 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CNGA3Q16281 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CNGA3Q16281 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CNGA3Q16281 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CNGA3Q16281 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CNGA3Q16281 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CNGA3Q16281 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CNGA3Q16281 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CNGA3Q16281 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CNGA3Q16281 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CNGA3Q16281 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CNGA3Q16281 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CNGA3Q16281 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CNGA3Q16281 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CNGA3Q16281 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CNGA3Q16281 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CNGA3Q16281 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CNGA3Q16281 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CNGA3Q16281 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CNGA3Q16281 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CNGA3Q16281 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CNGA3Q16281 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CNGA3Q16281 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CNGA3Q16281 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CNGA3Q16281 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CNGA3Q16281 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CNGA3Q16281 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CNGA3Q16281 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CNGA3Q16281 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CNGA3Q16281 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CNGA3Q16281 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CNGA3Q16281 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CNGA3Q16281 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CNGA3Q16281 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CNGA3Q16281 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CNGA3Q16281 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CNGA3Q16281 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CNGA3Q16281 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CNGA3Q16281 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CNGA3Q16281 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CNGA3Q16281 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CNGA3Q16281 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CNGA3Q16281 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CNGA3Q16281 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CNGA3Q16281 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CNGA3Q16281 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CNGA3Q16281 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CNGA3Q16281 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CNGA3Q16281 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CNGA3Q16281 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CNGA3Q16281 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CNGA3Q16281 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CNGA3Q16281 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CNGA3Q16281 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CNGA3Q16281 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CNGA3Q16281 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CNGA3Q16281 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CNGA3Q16281 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CNGA3Q16281 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CNGA3Q16281 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CNGA3Q16281 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CNGA3Q16281 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CNGA3Q16281 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CNGA3Q16281 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CNGA3Q16281 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CNGA3Q16281 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CNGA3Q16281 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CNGA3Q16281 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CNGA3Q16281 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CNGA3Q16281 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CNGA3Q16281 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CNGA3Q16281 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CNGA3Q16281 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CNGA3Q16281 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CNGA3Q16281 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CNGA3Q16281 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CNGA3Q16281 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CNGA3Q16281 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CNGA3Q16281 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CNGA3Q16281 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CNGA3Q16281 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CNGA3Q16281 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CNGA3Q16281 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CNGA3Q16281 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CNGA3Q16281 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CNGA3Q16281 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CNGA3Q16281 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CNGA3Q16281 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CNGA3Q16281 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CNGA3Q16281 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CNGA3Q16281 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CNGA3Q16281 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CNGA3Q16281 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CNGA3Q16281 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CNGA3Q16281 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CNGA3Q16281 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CNGA3Q16281 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CNGA3Q16281 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CNGA3Q16281 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
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