Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC85BQ15834 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC85BQ15834 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC85BQ15834 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC85BQ15834 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC85BQ15834 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC85BQ15834 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC85BQ15834 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC85BQ15834 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC85BQ15834 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC85BQ15834 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC85BQ15834 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC85BQ15834 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC85BQ15834 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC85BQ15834 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC85BQ15834 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC85BQ15834 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC85BQ15834 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC85BQ15834 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC85BQ15834 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CCDC85BQ15834 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
CCDC85BQ15834 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC85BQ15834 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC85BQ15834 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC85BQ15834 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC85BQ15834 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC85BQ15834 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC85BQ15834 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC85BQ15834 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC85BQ15834 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC85BQ15834 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC85BQ15834 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC85BQ15834 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC85BQ15834 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC85BQ15834 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC85BQ15834 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC85BQ15834 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC85BQ15834 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC85BQ15834 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC85BQ15834 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC85BQ15834 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC85BQ15834 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC85BQ15834 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC85BQ15834 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC85BQ15834 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC85BQ15834 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC85BQ15834 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC85BQ15834 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC85BQ15834 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC85BQ15834 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC85BQ15834 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC85BQ15834 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC85BQ15834 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC85BQ15834 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC85BQ15834 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC85BQ15834 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC85BQ15834 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC85BQ15834 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC85BQ15834 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC85BQ15834 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC85BQ15834 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC85BQ15834 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC85BQ15834 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC85BQ15834 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC85BQ15834 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC85BQ15834 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC85BQ15834 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC85BQ15834 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC85BQ15834 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC85BQ15834 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC85BQ15834 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC85BQ15834 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC85BQ15834 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC85BQ15834 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC85BQ15834 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC85BQ15834 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC85BQ15834 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC85BQ15834 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC85BQ15834 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC85BQ15834 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC85BQ15834 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC85BQ15834 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC85BQ15834 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC85BQ15834 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC85BQ15834 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC85BQ15834 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC85BQ15834 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC85BQ15834 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC85BQ15834 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC85BQ15834 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC85BQ15834 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC85BQ15834 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC85BQ15834 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC85BQ15834 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC85BQ15834 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC85BQ15834 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC85BQ15834 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC85BQ15834 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC85BQ15834 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC85BQ15834 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
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