Protein–RNA interactions for Protein: Q15361

TTF1, Transcription termination factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 905 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF1Q15361 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TTF1Q15361 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TTF1Q15361 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TTF1Q15361 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TTF1Q15361 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TTF1Q15361 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TTF1Q15361 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TTF1Q15361 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TTF1Q15361 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TTF1Q15361 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TTF1Q15361 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TTF1Q15361 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TTF1Q15361 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TTF1Q15361 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TTF1Q15361 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TTF1Q15361 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
TTF1Q15361 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TTF1Q15361 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TTF1Q15361 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TTF1Q15361 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TTF1Q15361 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TTF1Q15361 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TTF1Q15361 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TTF1Q15361 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TTF1Q15361 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TTF1Q15361 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TTF1Q15361 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TTF1Q15361 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TTF1Q15361 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TTF1Q15361 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TTF1Q15361 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TTF1Q15361 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TTF1Q15361 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TTF1Q15361 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TTF1Q15361 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TTF1Q15361 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TTF1Q15361 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TTF1Q15361 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TTF1Q15361 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TTF1Q15361 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TTF1Q15361 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TTF1Q15361 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TTF1Q15361 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TTF1Q15361 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TTF1Q15361 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TTF1Q15361 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TTF1Q15361 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TTF1Q15361 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TTF1Q15361 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TTF1Q15361 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TTF1Q15361 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TTF1Q15361 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TTF1Q15361 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TTF1Q15361 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TTF1Q15361 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TTF1Q15361 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TTF1Q15361 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TTF1Q15361 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TTF1Q15361 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TTF1Q15361 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TTF1Q15361 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TTF1Q15361 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TTF1Q15361 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TTF1Q15361 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TTF1Q15361 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TTF1Q15361 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TTF1Q15361 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TTF1Q15361 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TTF1Q15361 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TTF1Q15361 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TTF1Q15361 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TTF1Q15361 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
TTF1Q15361 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TTF1Q15361 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TTF1Q15361 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TTF1Q15361 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TTF1Q15361 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TTF1Q15361 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TTF1Q15361 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TTF1Q15361 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TTF1Q15361 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TTF1Q15361 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TTF1Q15361 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TTF1Q15361 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TTF1Q15361 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TTF1Q15361 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TTF1Q15361 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TTF1Q15361 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TTF1Q15361 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TTF1Q15361 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TTF1Q15361 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TTF1Q15361 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TTF1Q15361 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TTF1Q15361 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TTF1Q15361 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TTF1Q15361 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TTF1Q15361 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TTF1Q15361 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TTF1Q15361 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TTF1Q15361 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
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