Protein–RNA interactions for Protein: Q14574

DSC3, Desmocollin-3, humanhuman

Predictions only

Length 896 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC3Q14574 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DSC3Q14574 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DSC3Q14574 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DSC3Q14574 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DSC3Q14574 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DSC3Q14574 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DSC3Q14574 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DSC3Q14574 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DSC3Q14574 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DSC3Q14574 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DSC3Q14574 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DSC3Q14574 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DSC3Q14574 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
DSC3Q14574 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DSC3Q14574 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DSC3Q14574 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DSC3Q14574 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DSC3Q14574 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DSC3Q14574 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DSC3Q14574 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DSC3Q14574 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DSC3Q14574 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
DSC3Q14574 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DSC3Q14574 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DSC3Q14574 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DSC3Q14574 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DSC3Q14574 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DSC3Q14574 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DSC3Q14574 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DSC3Q14574 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DSC3Q14574 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DSC3Q14574 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DSC3Q14574 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DSC3Q14574 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DSC3Q14574 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
DSC3Q14574 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DSC3Q14574 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DSC3Q14574 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DSC3Q14574 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DSC3Q14574 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DSC3Q14574 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
DSC3Q14574 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
DSC3Q14574 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
DSC3Q14574 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DSC3Q14574 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DSC3Q14574 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DSC3Q14574 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DSC3Q14574 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DSC3Q14574 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
DSC3Q14574 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DSC3Q14574 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DSC3Q14574 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DSC3Q14574 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DSC3Q14574 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DSC3Q14574 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
DSC3Q14574 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DSC3Q14574 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DSC3Q14574 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DSC3Q14574 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DSC3Q14574 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DSC3Q14574 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DSC3Q14574 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DSC3Q14574 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DSC3Q14574 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DSC3Q14574 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DSC3Q14574 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DSC3Q14574 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
DSC3Q14574 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DSC3Q14574 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DSC3Q14574 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DSC3Q14574 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
DSC3Q14574 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
DSC3Q14574 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DSC3Q14574 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DSC3Q14574 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DSC3Q14574 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DSC3Q14574 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DSC3Q14574 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DSC3Q14574 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DSC3Q14574 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DSC3Q14574 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DSC3Q14574 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DSC3Q14574 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DSC3Q14574 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DSC3Q14574 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DSC3Q14574 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DSC3Q14574 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DSC3Q14574 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
DSC3Q14574 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DSC3Q14574 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DSC3Q14574 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DSC3Q14574 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DSC3Q14574 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DSC3Q14574 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DSC3Q14574 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DSC3Q14574 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DSC3Q14574 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DSC3Q14574 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DSC3Q14574 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
DSC3Q14574 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms