Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCINQ13939 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCINQ13939 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCINQ13939 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCINQ13939 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCINQ13939 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCINQ13939 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCINQ13939 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCINQ13939 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCINQ13939 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCINQ13939 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCINQ13939 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCINQ13939 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCINQ13939 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCINQ13939 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCINQ13939 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCINQ13939 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCINQ13939 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCINQ13939 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCINQ13939 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CCINQ13939 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CCINQ13939 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCINQ13939 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CCINQ13939 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCINQ13939 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCINQ13939 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCINQ13939 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CCINQ13939 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCINQ13939 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCINQ13939 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CCINQ13939 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCINQ13939 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCINQ13939 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCINQ13939 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCINQ13939 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CCINQ13939 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCINQ13939 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCINQ13939 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCINQ13939 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CCINQ13939 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCINQ13939 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CCINQ13939 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCINQ13939 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CCINQ13939 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CCINQ13939 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCINQ13939 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCINQ13939 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CCINQ13939 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCINQ13939 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCINQ13939 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCINQ13939 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCINQ13939 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCINQ13939 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCINQ13939 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCINQ13939 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCINQ13939 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCINQ13939 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCINQ13939 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCINQ13939 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCINQ13939 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCINQ13939 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCINQ13939 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCINQ13939 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCINQ13939 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCINQ13939 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCINQ13939 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCINQ13939 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCINQ13939 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCINQ13939 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCINQ13939 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CCINQ13939 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCINQ13939 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCINQ13939 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCINQ13939 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCINQ13939 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCINQ13939 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCINQ13939 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCINQ13939 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCINQ13939 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCINQ13939 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCINQ13939 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCINQ13939 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCINQ13939 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCINQ13939 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCINQ13939 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCINQ13939 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCINQ13939 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CCINQ13939 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCINQ13939 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CCINQ13939 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCINQ13939 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCINQ13939 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCINQ13939 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCINQ13939 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCINQ13939 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCINQ13939 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCINQ13939 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCINQ13939 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCINQ13939 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCINQ13939 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
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