Protein–RNA interactions for Protein: Q13938

CAPS, Calcyphosin, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPSQ13938 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CAPSQ13938 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CAPSQ13938 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CAPSQ13938 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CAPSQ13938 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CAPSQ13938 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CAPSQ13938 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CAPSQ13938 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CAPSQ13938 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CAPSQ13938 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CAPSQ13938 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CAPSQ13938 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CAPSQ13938 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CAPSQ13938 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CAPSQ13938 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CAPSQ13938 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CAPSQ13938 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CAPSQ13938 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CAPSQ13938 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CAPSQ13938 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CAPSQ13938 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CAPSQ13938 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CAPSQ13938 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CAPSQ13938 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CAPSQ13938 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CAPSQ13938 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CAPSQ13938 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CAPSQ13938 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CAPSQ13938 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CAPSQ13938 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CAPSQ13938 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CAPSQ13938 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CAPSQ13938 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CAPSQ13938 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CAPSQ13938 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CAPSQ13938 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CAPSQ13938 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CAPSQ13938 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CAPSQ13938 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CAPSQ13938 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CAPSQ13938 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CAPSQ13938 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CAPSQ13938 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CAPSQ13938 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CAPSQ13938 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CAPSQ13938 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CAPSQ13938 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CAPSQ13938 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CAPSQ13938 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CAPSQ13938 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CAPSQ13938 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CAPSQ13938 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CAPSQ13938 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CAPSQ13938 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CAPSQ13938 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CAPSQ13938 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CAPSQ13938 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CAPSQ13938 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CAPSQ13938 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CAPSQ13938 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CAPSQ13938 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CAPSQ13938 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CAPSQ13938 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CAPSQ13938 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CAPSQ13938 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CAPSQ13938 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CAPSQ13938 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CAPSQ13938 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CAPSQ13938 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CAPSQ13938 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CAPSQ13938 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CAPSQ13938 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CAPSQ13938 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CAPSQ13938 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CAPSQ13938 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CAPSQ13938 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CAPSQ13938 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CAPSQ13938 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CAPSQ13938 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CAPSQ13938 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CAPSQ13938 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CAPSQ13938 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CAPSQ13938 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CAPSQ13938 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CAPSQ13938 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CAPSQ13938 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CAPSQ13938 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CAPSQ13938 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CAPSQ13938 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CAPSQ13938 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CAPSQ13938 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CAPSQ13938 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CAPSQ13938 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CAPSQ13938 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CAPSQ13938 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CAPSQ13938 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CAPSQ13938 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CAPSQ13938 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CAPSQ13938 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CAPSQ13938 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
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