Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
APOFQ13790 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
APOFQ13790 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
APOFQ13790 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
APOFQ13790 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
APOFQ13790 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
APOFQ13790 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
APOFQ13790 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
APOFQ13790 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
APOFQ13790 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
APOFQ13790 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
APOFQ13790 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
APOFQ13790 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
APOFQ13790 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
APOFQ13790 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
APOFQ13790 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
APOFQ13790 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
APOFQ13790 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
APOFQ13790 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
APOFQ13790 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
APOFQ13790 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
APOFQ13790 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOFQ13790 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOFQ13790 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOFQ13790 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOFQ13790 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOFQ13790 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOFQ13790 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOFQ13790 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOFQ13790 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOFQ13790 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
APOFQ13790 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOFQ13790 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOFQ13790 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOFQ13790 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOFQ13790 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOFQ13790 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOFQ13790 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOFQ13790 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOFQ13790 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
APOFQ13790 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
APOFQ13790 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
APOFQ13790 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
APOFQ13790 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
APOFQ13790 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
APOFQ13790 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
APOFQ13790 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
APOFQ13790 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
APOFQ13790 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
APOFQ13790 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
APOFQ13790 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
APOFQ13790 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
APOFQ13790 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
APOFQ13790 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
APOFQ13790 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
APOFQ13790 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
APOFQ13790 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
APOFQ13790 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
APOFQ13790 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
APOFQ13790 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
APOFQ13790 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
APOFQ13790 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
APOFQ13790 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
APOFQ13790 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
APOFQ13790 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
APOFQ13790 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
APOFQ13790 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
APOFQ13790 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
APOFQ13790 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
APOFQ13790 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
APOFQ13790 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
APOFQ13790 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOFQ13790 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOFQ13790 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOFQ13790 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOFQ13790 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOFQ13790 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOFQ13790 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOFQ13790 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOFQ13790 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOFQ13790 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOFQ13790 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOFQ13790 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
APOFQ13790 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOFQ13790 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOFQ13790 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
APOFQ13790 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOFQ13790 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOFQ13790 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOFQ13790 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOFQ13790 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOFQ13790 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOFQ13790 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOFQ13790 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOFQ13790 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOFQ13790 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOFQ13790 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOFQ13790 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOFQ13790 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
APOFQ13790 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
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