Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TUBA3CQ13748 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TUBA3CQ13748 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
TUBA3CQ13748 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TUBA3CQ13748 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TUBA3CQ13748 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TUBA3CQ13748 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TUBA3CQ13748 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TUBA3CQ13748 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TUBA3CQ13748 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TUBA3CQ13748 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TUBA3CQ13748 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TUBA3CQ13748 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TUBA3CQ13748 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TUBA3CQ13748 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TUBA3CQ13748 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TUBA3CQ13748 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TUBA3CQ13748 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TUBA3CQ13748 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TUBA3CQ13748 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
TUBA3CQ13748 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TUBA3CQ13748 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TUBA3CQ13748 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TUBA3CQ13748 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TUBA3CQ13748 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TUBA3CQ13748 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TUBA3CQ13748 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TUBA3CQ13748 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TUBA3CQ13748 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TUBA3CQ13748 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TUBA3CQ13748 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TUBA3CQ13748 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TUBA3CQ13748 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TUBA3CQ13748 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TUBA3CQ13748 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
TUBA3CQ13748 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TUBA3CQ13748 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TUBA3CQ13748 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TUBA3CQ13748 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TUBA3CQ13748 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TUBA3CQ13748 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TUBA3CQ13748 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TUBA3CQ13748 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TUBA3CQ13748 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TUBA3CQ13748 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TUBA3CQ13748 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TUBA3CQ13748 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
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TUBA3CQ13748 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TUBA3CQ13748 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TUBA3CQ13748 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TUBA3CQ13748 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
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TUBA3CQ13748 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TUBA3CQ13748 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TUBA3CQ13748 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TUBA3CQ13748 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TUBA3CQ13748 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TUBA3CQ13748 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TUBA3CQ13748 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TUBA3CQ13748 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TUBA3CQ13748 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TUBA3CQ13748 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
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TUBA3CQ13748 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
TUBA3CQ13748 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TUBA3CQ13748 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
TUBA3CQ13748 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TUBA3CQ13748 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TUBA3CQ13748 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TUBA3CQ13748 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TUBA3CQ13748 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TUBA3CQ13748 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TUBA3CQ13748 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TUBA3CQ13748 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TUBA3CQ13748 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
TUBA3CQ13748 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TUBA3CQ13748 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TUBA3CQ13748 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TUBA3CQ13748 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TUBA3CQ13748 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TUBA3CQ13748 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TUBA3CQ13748 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TUBA3CQ13748 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TUBA3CQ13748 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TUBA3CQ13748 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TUBA3CQ13748 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TUBA3CQ13748 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TUBA3CQ13748 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TUBA3CQ13748 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TUBA3CQ13748 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TUBA3CQ13748 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TUBA3CQ13748 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TUBA3CQ13748 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TUBA3CQ13748 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TUBA3CQ13748 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TUBA3CQ13748 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TUBA3CQ13748 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TUBA3CQ13748 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TUBA3CQ13748 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
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