Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MTMR3Q13615 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MTMR3Q13615 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MTMR3Q13615 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MTMR3Q13615 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MTMR3Q13615 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MTMR3Q13615 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
MTMR3Q13615 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
MTMR3Q13615 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MTMR3Q13615 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MTMR3Q13615 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MTMR3Q13615 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MTMR3Q13615 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MTMR3Q13615 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MTMR3Q13615 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MTMR3Q13615 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MTMR3Q13615 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MTMR3Q13615 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MTMR3Q13615 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MTMR3Q13615 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MTMR3Q13615 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MTMR3Q13615 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MTMR3Q13615 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MTMR3Q13615 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MTMR3Q13615 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MTMR3Q13615 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
MTMR3Q13615 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MTMR3Q13615 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MTMR3Q13615 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MTMR3Q13615 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MTMR3Q13615 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MTMR3Q13615 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MTMR3Q13615 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MTMR3Q13615 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MTMR3Q13615 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MTMR3Q13615 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MTMR3Q13615 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MTMR3Q13615 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MTMR3Q13615 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MTMR3Q13615 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MTMR3Q13615 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MTMR3Q13615 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MTMR3Q13615 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
MTMR3Q13615 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MTMR3Q13615 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MTMR3Q13615 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MTMR3Q13615 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MTMR3Q13615 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MTMR3Q13615 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MTMR3Q13615 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MTMR3Q13615 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MTMR3Q13615 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MTMR3Q13615 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MTMR3Q13615 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MTMR3Q13615 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MTMR3Q13615 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MTMR3Q13615 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MTMR3Q13615 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MTMR3Q13615 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MTMR3Q13615 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MTMR3Q13615 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MTMR3Q13615 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MTMR3Q13615 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MTMR3Q13615 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MTMR3Q13615 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MTMR3Q13615 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MTMR3Q13615 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MTMR3Q13615 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MTMR3Q13615 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MTMR3Q13615 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MTMR3Q13615 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MTMR3Q13615 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MTMR3Q13615 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MTMR3Q13615 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MTMR3Q13615 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MTMR3Q13615 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MTMR3Q13615 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MTMR3Q13615 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MTMR3Q13615 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MTMR3Q13615 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MTMR3Q13615 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MTMR3Q13615 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MTMR3Q13615 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MTMR3Q13615 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MTMR3Q13615 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MTMR3Q13615 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MTMR3Q13615 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MTMR3Q13615 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MTMR3Q13615 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MTMR3Q13615 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MTMR3Q13615 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MTMR3Q13615 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MTMR3Q13615 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MTMR3Q13615 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MTMR3Q13615 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MTMR3Q13615 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MTMR3Q13615 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MTMR3Q13615 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MTMR3Q13615 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MTMR3Q13615 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms