Protein–RNA interactions for Protein: Q13563

PKD2, Polycystin-2, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2Q13563 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PKD2Q13563 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
PKD2Q13563 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PKD2Q13563 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PKD2Q13563 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PKD2Q13563 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PKD2Q13563 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PKD2Q13563 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PKD2Q13563 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PKD2Q13563 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PKD2Q13563 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PKD2Q13563 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PKD2Q13563 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PKD2Q13563 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PKD2Q13563 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PKD2Q13563 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PKD2Q13563 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PKD2Q13563 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PKD2Q13563 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PKD2Q13563 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PKD2Q13563 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PKD2Q13563 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PKD2Q13563 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PKD2Q13563 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PKD2Q13563 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PKD2Q13563 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PKD2Q13563 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PKD2Q13563 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
PKD2Q13563 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PKD2Q13563 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PKD2Q13563 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PKD2Q13563 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
PKD2Q13563 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PKD2Q13563 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
PKD2Q13563 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PKD2Q13563 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PKD2Q13563 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PKD2Q13563 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PKD2Q13563 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PKD2Q13563 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
PKD2Q13563 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
PKD2Q13563 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PKD2Q13563 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PKD2Q13563 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PKD2Q13563 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PKD2Q13563 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PKD2Q13563 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PKD2Q13563 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PKD2Q13563 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PKD2Q13563 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PKD2Q13563 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PKD2Q13563 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PKD2Q13563 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PKD2Q13563 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PKD2Q13563 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PKD2Q13563 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PKD2Q13563 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
PKD2Q13563 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PKD2Q13563 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
PKD2Q13563 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
PKD2Q13563 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PKD2Q13563 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PKD2Q13563 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PKD2Q13563 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PKD2Q13563 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PKD2Q13563 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PKD2Q13563 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PKD2Q13563 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PKD2Q13563 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PKD2Q13563 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PKD2Q13563 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PKD2Q13563 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
PKD2Q13563 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PKD2Q13563 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PKD2Q13563 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PKD2Q13563 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PKD2Q13563 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PKD2Q13563 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PKD2Q13563 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PKD2Q13563 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PKD2Q13563 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PKD2Q13563 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PKD2Q13563 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
PKD2Q13563 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PKD2Q13563 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PKD2Q13563 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PKD2Q13563 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PKD2Q13563 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PKD2Q13563 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PKD2Q13563 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PKD2Q13563 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PKD2Q13563 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PKD2Q13563 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PKD2Q13563 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PKD2Q13563 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PKD2Q13563 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PKD2Q13563 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PKD2Q13563 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PKD2Q13563 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PKD2Q13563 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
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