Protein–RNA interactions for Protein: Q13491

GPM6B, Neuronal membrane glycoprotein M6-b, humanhuman

Predictions only

Length 265 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPM6BQ13491 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GPM6BQ13491 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
GPM6BQ13491 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GPM6BQ13491 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GPM6BQ13491 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
GPM6BQ13491 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GPM6BQ13491 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
GPM6BQ13491 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GPM6BQ13491 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GPM6BQ13491 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.95
GPM6BQ13491 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
GPM6BQ13491 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
GPM6BQ13491 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GPM6BQ13491 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GPM6BQ13491 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GPM6BQ13491 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GPM6BQ13491 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
GPM6BQ13491 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GPM6BQ13491 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GPM6BQ13491 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GPM6BQ13491 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GPM6BQ13491 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
GPM6BQ13491 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GPM6BQ13491 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GPM6BQ13491 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GPM6BQ13491 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GPM6BQ13491 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GPM6BQ13491 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GPM6BQ13491 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GPM6BQ13491 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GPM6BQ13491 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GPM6BQ13491 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GPM6BQ13491 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
GPM6BQ13491 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
GPM6BQ13491 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GPM6BQ13491 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GPM6BQ13491 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GPM6BQ13491 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC21■□□□□ 0.95
GPM6BQ13491 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC21■□□□□ 0.95
GPM6BQ13491 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
GPM6BQ13491 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC21■□□□□ 0.95
GPM6BQ13491 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
GPM6BQ13491 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GPM6BQ13491 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
GPM6BQ13491 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GPM6BQ13491 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
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GPM6BQ13491 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC21■□□□□ 0.95
GPM6BQ13491 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
GPM6BQ13491 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
GPM6BQ13491 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GPM6BQ13491 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GPM6BQ13491 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GPM6BQ13491 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GPM6BQ13491 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GPM6BQ13491 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GPM6BQ13491 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
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GPM6BQ13491 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GPM6BQ13491 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GPM6BQ13491 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GPM6BQ13491 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
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GPM6BQ13491 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GPM6BQ13491 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GPM6BQ13491 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GPM6BQ13491 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GPM6BQ13491 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GPM6BQ13491 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GPM6BQ13491 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GPM6BQ13491 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GPM6BQ13491 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GPM6BQ13491 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GPM6BQ13491 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GPM6BQ13491 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GPM6BQ13491 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GPM6BQ13491 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GPM6BQ13491 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
GPM6BQ13491 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
GPM6BQ13491 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GPM6BQ13491 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GPM6BQ13491 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GPM6BQ13491 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GPM6BQ13491 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GPM6BQ13491 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GPM6BQ13491 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GPM6BQ13491 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GPM6BQ13491 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GPM6BQ13491 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GPM6BQ13491 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GPM6BQ13491 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GPM6BQ13491 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GPM6BQ13491 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GPM6BQ13491 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
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