Protein–RNA interactions for Protein: Q13351

KLF1, Krueppel-like factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF1Q13351 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLF1Q13351 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLF1Q13351 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLF1Q13351 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLF1Q13351 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLF1Q13351 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLF1Q13351 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLF1Q13351 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLF1Q13351 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLF1Q13351 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLF1Q13351 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLF1Q13351 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLF1Q13351 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLF1Q13351 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLF1Q13351 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLF1Q13351 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLF1Q13351 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLF1Q13351 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLF1Q13351 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLF1Q13351 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLF1Q13351 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLF1Q13351 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLF1Q13351 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLF1Q13351 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLF1Q13351 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLF1Q13351 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLF1Q13351 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
KLF1Q13351 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLF1Q13351 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
KLF1Q13351 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLF1Q13351 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLF1Q13351 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLF1Q13351 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
KLF1Q13351 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLF1Q13351 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLF1Q13351 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLF1Q13351 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLF1Q13351 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLF1Q13351 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLF1Q13351 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLF1Q13351 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLF1Q13351 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLF1Q13351 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLF1Q13351 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLF1Q13351 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLF1Q13351 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLF1Q13351 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLF1Q13351 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLF1Q13351 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLF1Q13351 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLF1Q13351 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLF1Q13351 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
KLF1Q13351 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLF1Q13351 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
KLF1Q13351 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
KLF1Q13351 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLF1Q13351 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLF1Q13351 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLF1Q13351 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLF1Q13351 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLF1Q13351 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLF1Q13351 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLF1Q13351 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLF1Q13351 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLF1Q13351 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
KLF1Q13351 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLF1Q13351 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
KLF1Q13351 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLF1Q13351 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLF1Q13351 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLF1Q13351 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
KLF1Q13351 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLF1Q13351 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLF1Q13351 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLF1Q13351 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
KLF1Q13351 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLF1Q13351 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLF1Q13351 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLF1Q13351 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLF1Q13351 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
KLF1Q13351 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLF1Q13351 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLF1Q13351 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLF1Q13351 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLF1Q13351 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLF1Q13351 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLF1Q13351 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLF1Q13351 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLF1Q13351 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLF1Q13351 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLF1Q13351 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLF1Q13351 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLF1Q13351 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLF1Q13351 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLF1Q13351 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLF1Q13351 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLF1Q13351 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLF1Q13351 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLF1Q13351 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLF1Q13351 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms