Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NME3Q13232 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NME3Q13232 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NME3Q13232 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
NME3Q13232 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NME3Q13232 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NME3Q13232 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NME3Q13232 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NME3Q13232 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
NME3Q13232 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NME3Q13232 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NME3Q13232 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NME3Q13232 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NME3Q13232 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NME3Q13232 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NME3Q13232 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NME3Q13232 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NME3Q13232 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NME3Q13232 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NME3Q13232 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NME3Q13232 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NME3Q13232 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NME3Q13232 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NME3Q13232 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NME3Q13232 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NME3Q13232 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NME3Q13232 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NME3Q13232 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NME3Q13232 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NME3Q13232 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NME3Q13232 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NME3Q13232 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NME3Q13232 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
NME3Q13232 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
NME3Q13232 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NME3Q13232 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
NME3Q13232 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NME3Q13232 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NME3Q13232 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NME3Q13232 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NME3Q13232 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NME3Q13232 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NME3Q13232 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NME3Q13232 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NME3Q13232 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NME3Q13232 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NME3Q13232 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NME3Q13232 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
NME3Q13232 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
NME3Q13232 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NME3Q13232 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NME3Q13232 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NME3Q13232 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NME3Q13232 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
NME3Q13232 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NME3Q13232 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NME3Q13232 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NME3Q13232 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NME3Q13232 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NME3Q13232 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NME3Q13232 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NME3Q13232 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NME3Q13232 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NME3Q13232 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NME3Q13232 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NME3Q13232 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NME3Q13232 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NME3Q13232 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NME3Q13232 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NME3Q13232 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NME3Q13232 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NME3Q13232 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
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NME3Q13232 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NME3Q13232 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NME3Q13232 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NME3Q13232 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
NME3Q13232 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NME3Q13232 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NME3Q13232 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NME3Q13232 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NME3Q13232 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NME3Q13232 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NME3Q13232 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NME3Q13232 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NME3Q13232 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NME3Q13232 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
NME3Q13232 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NME3Q13232 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NME3Q13232 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NME3Q13232 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NME3Q13232 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NME3Q13232 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NME3Q13232 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NME3Q13232 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NME3Q13232 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NME3Q13232 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NME3Q13232 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NME3Q13232 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
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