Protein–RNA interactions for Protein: Q13113

PDZK1IP1, PDZK1-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZK1IP1Q13113 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PDZK1IP1Q13113 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PDZK1IP1Q13113 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PDZK1IP1Q13113 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PDZK1IP1Q13113 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PDZK1IP1Q13113 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
PDZK1IP1Q13113 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PDZK1IP1Q13113 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PDZK1IP1Q13113 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PDZK1IP1Q13113 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PDZK1IP1Q13113 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PDZK1IP1Q13113 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PDZK1IP1Q13113 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PDZK1IP1Q13113 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PDZK1IP1Q13113 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PDZK1IP1Q13113 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PDZK1IP1Q13113 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PDZK1IP1Q13113 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PDZK1IP1Q13113 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PDZK1IP1Q13113 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PDZK1IP1Q13113 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PDZK1IP1Q13113 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PDZK1IP1Q13113 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PDZK1IP1Q13113 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PDZK1IP1Q13113 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PDZK1IP1Q13113 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PDZK1IP1Q13113 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PDZK1IP1Q13113 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PDZK1IP1Q13113 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PDZK1IP1Q13113 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PDZK1IP1Q13113 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PDZK1IP1Q13113 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PDZK1IP1Q13113 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDZK1IP1Q13113 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDZK1IP1Q13113 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDZK1IP1Q13113 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDZK1IP1Q13113 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDZK1IP1Q13113 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDZK1IP1Q13113 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDZK1IP1Q13113 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDZK1IP1Q13113 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDZK1IP1Q13113 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDZK1IP1Q13113 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDZK1IP1Q13113 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDZK1IP1Q13113 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDZK1IP1Q13113 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDZK1IP1Q13113 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDZK1IP1Q13113 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDZK1IP1Q13113 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDZK1IP1Q13113 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDZK1IP1Q13113 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PDZK1IP1Q13113 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDZK1IP1Q13113 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDZK1IP1Q13113 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDZK1IP1Q13113 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDZK1IP1Q13113 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDZK1IP1Q13113 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDZK1IP1Q13113 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDZK1IP1Q13113 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDZK1IP1Q13113 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDZK1IP1Q13113 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDZK1IP1Q13113 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDZK1IP1Q13113 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDZK1IP1Q13113 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDZK1IP1Q13113 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDZK1IP1Q13113 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDZK1IP1Q13113 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDZK1IP1Q13113 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDZK1IP1Q13113 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDZK1IP1Q13113 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDZK1IP1Q13113 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDZK1IP1Q13113 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PDZK1IP1Q13113 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDZK1IP1Q13113 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDZK1IP1Q13113 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDZK1IP1Q13113 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDZK1IP1Q13113 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDZK1IP1Q13113 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDZK1IP1Q13113 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDZK1IP1Q13113 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDZK1IP1Q13113 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PDZK1IP1Q13113 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDZK1IP1Q13113 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDZK1IP1Q13113 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDZK1IP1Q13113 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PDZK1IP1Q13113 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PDZK1IP1Q13113 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PDZK1IP1Q13113 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PDZK1IP1Q13113 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PDZK1IP1Q13113 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PDZK1IP1Q13113 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PDZK1IP1Q13113 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PDZK1IP1Q13113 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PDZK1IP1Q13113 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PDZK1IP1Q13113 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PDZK1IP1Q13113 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PDZK1IP1Q13113 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PDZK1IP1Q13113 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PDZK1IP1Q13113 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PDZK1IP1Q13113 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms