Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BNIP1Q12981 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BNIP1Q12981 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BNIP1Q12981 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BNIP1Q12981 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BNIP1Q12981 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BNIP1Q12981 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BNIP1Q12981 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BNIP1Q12981 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
BNIP1Q12981 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BNIP1Q12981 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BNIP1Q12981 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BNIP1Q12981 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BNIP1Q12981 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BNIP1Q12981 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BNIP1Q12981 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BNIP1Q12981 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BNIP1Q12981 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BNIP1Q12981 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
BNIP1Q12981 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
BNIP1Q12981 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BNIP1Q12981 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
BNIP1Q12981 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
BNIP1Q12981 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BNIP1Q12981 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
BNIP1Q12981 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BNIP1Q12981 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BNIP1Q12981 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BNIP1Q12981 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BNIP1Q12981 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BNIP1Q12981 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BNIP1Q12981 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
BNIP1Q12981 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BNIP1Q12981 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BNIP1Q12981 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BNIP1Q12981 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
BNIP1Q12981 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BNIP1Q12981 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
BNIP1Q12981 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
BNIP1Q12981 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BNIP1Q12981 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BNIP1Q12981 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BNIP1Q12981 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BNIP1Q12981 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
BNIP1Q12981 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
BNIP1Q12981 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BNIP1Q12981 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
BNIP1Q12981 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BNIP1Q12981 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
BNIP1Q12981 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
BNIP1Q12981 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
BNIP1Q12981 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
BNIP1Q12981 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
BNIP1Q12981 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
BNIP1Q12981 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
BNIP1Q12981 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
BNIP1Q12981 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
BNIP1Q12981 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
BNIP1Q12981 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
BNIP1Q12981 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
BNIP1Q12981 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
BNIP1Q12981 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
BNIP1Q12981 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
BNIP1Q12981 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
BNIP1Q12981 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
BNIP1Q12981 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
BNIP1Q12981 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
BNIP1Q12981 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
BNIP1Q12981 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
BNIP1Q12981 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
BNIP1Q12981 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
BNIP1Q12981 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
BNIP1Q12981 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
BNIP1Q12981 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
BNIP1Q12981 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
BNIP1Q12981 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
BNIP1Q12981 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
BNIP1Q12981 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
BNIP1Q12981 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
BNIP1Q12981 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
BNIP1Q12981 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
BNIP1Q12981 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
BNIP1Q12981 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
BNIP1Q12981 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
BNIP1Q12981 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
BNIP1Q12981 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
BNIP1Q12981 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
BNIP1Q12981 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
BNIP1Q12981 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
BNIP1Q12981 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
BNIP1Q12981 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
BNIP1Q12981 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
BNIP1Q12981 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
BNIP1Q12981 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
BNIP1Q12981 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
BNIP1Q12981 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
BNIP1Q12981 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
BNIP1Q12981 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
BNIP1Q12981 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
BNIP1Q12981 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
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