Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

Predictions only

Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRJQ12913 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRJQ12913 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRJQ12913 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRJQ12913 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRJQ12913 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRJQ12913 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRJQ12913 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRJQ12913 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRJQ12913 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRJQ12913 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRJQ12913 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRJQ12913 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRJQ12913 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRJQ12913 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRJQ12913 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRJQ12913 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRJQ12913 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRJQ12913 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRJQ12913 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRJQ12913 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRJQ12913 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRJQ12913 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRJQ12913 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRJQ12913 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRJQ12913 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRJQ12913 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRJQ12913 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRJQ12913 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRJQ12913 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRJQ12913 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRJQ12913 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRJQ12913 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRJQ12913 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRJQ12913 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRJQ12913 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRJQ12913 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRJQ12913 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRJQ12913 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRJQ12913 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRJQ12913 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRJQ12913 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRJQ12913 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRJQ12913 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRJQ12913 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRJQ12913 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRJQ12913 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRJQ12913 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRJQ12913 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRJQ12913 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRJQ12913 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRJQ12913 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRJQ12913 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRJQ12913 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRJQ12913 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRJQ12913 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRJQ12913 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRJQ12913 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRJQ12913 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRJQ12913 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRJQ12913 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRJQ12913 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRJQ12913 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTPRJQ12913 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTPRJQ12913 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTPRJQ12913 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTPRJQ12913 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTPRJQ12913 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTPRJQ12913 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRJQ12913 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRJQ12913 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRJQ12913 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
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PTPRJQ12913 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
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PTPRJQ12913 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRJQ12913 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRJQ12913 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRJQ12913 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRJQ12913 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRJQ12913 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRJQ12913 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRJQ12913 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRJQ12913 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRJQ12913 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRJQ12913 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRJQ12913 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRJQ12913 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRJQ12913 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRJQ12913 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRJQ12913 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRJQ12913 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRJQ12913 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRJQ12913 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRJQ12913 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRJQ12913 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRJQ12913 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRJQ12913 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRJQ12913 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRJQ12913 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
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