Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAK6

LMOD3, Leiomodin-3, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD3Q0VAK6 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LMOD3Q0VAK6 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LMOD3Q0VAK6 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LMOD3Q0VAK6 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LMOD3Q0VAK6 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LMOD3Q0VAK6 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LMOD3Q0VAK6 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LMOD3Q0VAK6 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LMOD3Q0VAK6 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LMOD3Q0VAK6 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LMOD3Q0VAK6 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LMOD3Q0VAK6 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LMOD3Q0VAK6 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
LMOD3Q0VAK6 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LMOD3Q0VAK6 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LMOD3Q0VAK6 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LMOD3Q0VAK6 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LMOD3Q0VAK6 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LMOD3Q0VAK6 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LMOD3Q0VAK6 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LMOD3Q0VAK6 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LMOD3Q0VAK6 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LMOD3Q0VAK6 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LMOD3Q0VAK6 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LMOD3Q0VAK6 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LMOD3Q0VAK6 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LMOD3Q0VAK6 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LMOD3Q0VAK6 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LMOD3Q0VAK6 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LMOD3Q0VAK6 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LMOD3Q0VAK6 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LMOD3Q0VAK6 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LMOD3Q0VAK6 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LMOD3Q0VAK6 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LMOD3Q0VAK6 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LMOD3Q0VAK6 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LMOD3Q0VAK6 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LMOD3Q0VAK6 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
LMOD3Q0VAK6 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LMOD3Q0VAK6 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LMOD3Q0VAK6 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LMOD3Q0VAK6 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LMOD3Q0VAK6 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LMOD3Q0VAK6 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LMOD3Q0VAK6 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LMOD3Q0VAK6 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
LMOD3Q0VAK6 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LMOD3Q0VAK6 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LMOD3Q0VAK6 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LMOD3Q0VAK6 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LMOD3Q0VAK6 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LMOD3Q0VAK6 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LMOD3Q0VAK6 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LMOD3Q0VAK6 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LMOD3Q0VAK6 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LMOD3Q0VAK6 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LMOD3Q0VAK6 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LMOD3Q0VAK6 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LMOD3Q0VAK6 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LMOD3Q0VAK6 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LMOD3Q0VAK6 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LMOD3Q0VAK6 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LMOD3Q0VAK6 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LMOD3Q0VAK6 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LMOD3Q0VAK6 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LMOD3Q0VAK6 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LMOD3Q0VAK6 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LMOD3Q0VAK6 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LMOD3Q0VAK6 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LMOD3Q0VAK6 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LMOD3Q0VAK6 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LMOD3Q0VAK6 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LMOD3Q0VAK6 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
LMOD3Q0VAK6 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LMOD3Q0VAK6 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LMOD3Q0VAK6 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LMOD3Q0VAK6 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LMOD3Q0VAK6 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LMOD3Q0VAK6 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LMOD3Q0VAK6 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LMOD3Q0VAK6 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LMOD3Q0VAK6 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LMOD3Q0VAK6 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LMOD3Q0VAK6 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LMOD3Q0VAK6 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LMOD3Q0VAK6 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LMOD3Q0VAK6 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
LMOD3Q0VAK6 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LMOD3Q0VAK6 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LMOD3Q0VAK6 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
LMOD3Q0VAK6 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LMOD3Q0VAK6 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LMOD3Q0VAK6 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LMOD3Q0VAK6 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LMOD3Q0VAK6 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LMOD3Q0VAK6 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LMOD3Q0VAK6 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
LMOD3Q0VAK6 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
LMOD3Q0VAK6 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LMOD3Q0VAK6 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms