Protein–RNA interactions for Protein: Q08722

CD47, Leukocyte surface antigen CD47, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD47Q08722 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CD47Q08722 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CD47Q08722 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CD47Q08722 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CD47Q08722 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CD47Q08722 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CD47Q08722 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CD47Q08722 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CD47Q08722 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CD47Q08722 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CD47Q08722 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CD47Q08722 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CD47Q08722 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CD47Q08722 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CD47Q08722 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CD47Q08722 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CD47Q08722 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CD47Q08722 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CD47Q08722 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CD47Q08722 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CD47Q08722 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CD47Q08722 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CD47Q08722 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CD47Q08722 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CD47Q08722 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CD47Q08722 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CD47Q08722 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CD47Q08722 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CD47Q08722 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CD47Q08722 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CD47Q08722 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CD47Q08722 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CD47Q08722 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CD47Q08722 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CD47Q08722 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CD47Q08722 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CD47Q08722 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CD47Q08722 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CD47Q08722 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CD47Q08722 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CD47Q08722 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CD47Q08722 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CD47Q08722 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CD47Q08722 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CD47Q08722 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CD47Q08722 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CD47Q08722 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CD47Q08722 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CD47Q08722 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CD47Q08722 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CD47Q08722 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CD47Q08722 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CD47Q08722 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CD47Q08722 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CD47Q08722 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CD47Q08722 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CD47Q08722 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CD47Q08722 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CD47Q08722 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CD47Q08722 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CD47Q08722 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CD47Q08722 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CD47Q08722 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CD47Q08722 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CD47Q08722 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CD47Q08722 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CD47Q08722 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CD47Q08722 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CD47Q08722 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CD47Q08722 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CD47Q08722 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CD47Q08722 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CD47Q08722 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CD47Q08722 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CD47Q08722 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CD47Q08722 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CD47Q08722 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CD47Q08722 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CD47Q08722 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CD47Q08722 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CD47Q08722 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CD47Q08722 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CD47Q08722 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CD47Q08722 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CD47Q08722 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CD47Q08722 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CD47Q08722 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CD47Q08722 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CD47Q08722 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CD47Q08722 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CD47Q08722 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CD47Q08722 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CD47Q08722 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CD47Q08722 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CD47Q08722 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CD47Q08722 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CD47Q08722 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CD47Q08722 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CD47Q08722 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CD47Q08722 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms