Protein–RNA interactions for Protein: Q07864

POLE, DNA polymerase epsilon catalytic subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 2,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLEQ07864 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
POLEQ07864 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
POLEQ07864 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
POLEQ07864 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
POLEQ07864 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
POLEQ07864 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
POLEQ07864 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
POLEQ07864 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
POLEQ07864 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
POLEQ07864 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
POLEQ07864 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
POLEQ07864 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
POLEQ07864 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
POLEQ07864 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
POLEQ07864 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
POLEQ07864 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
POLEQ07864 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
POLEQ07864 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
POLEQ07864 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
POLEQ07864 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
POLEQ07864 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
POLEQ07864 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
POLEQ07864 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
POLEQ07864 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
POLEQ07864 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
POLEQ07864 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
POLEQ07864 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
POLEQ07864 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
POLEQ07864 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
POLEQ07864 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
POLEQ07864 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
POLEQ07864 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
POLEQ07864 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
POLEQ07864 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
POLEQ07864 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
POLEQ07864 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
POLEQ07864 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
POLEQ07864 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
POLEQ07864 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
POLEQ07864 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
POLEQ07864 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
POLEQ07864 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
POLEQ07864 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
POLEQ07864 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
POLEQ07864 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
POLEQ07864 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
POLEQ07864 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
POLEQ07864 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
POLEQ07864 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
POLEQ07864 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
POLEQ07864 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
POLEQ07864 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
POLEQ07864 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
POLEQ07864 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
POLEQ07864 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
POLEQ07864 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
POLEQ07864 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
POLEQ07864 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
POLEQ07864 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
POLEQ07864 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
POLEQ07864 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
POLEQ07864 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
POLEQ07864 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
POLEQ07864 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
POLEQ07864 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
POLEQ07864 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
POLEQ07864 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
POLEQ07864 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
POLEQ07864 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
POLEQ07864 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
POLEQ07864 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
POLEQ07864 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLEQ07864 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLEQ07864 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLEQ07864 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLEQ07864 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLEQ07864 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLEQ07864 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLEQ07864 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLEQ07864 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLEQ07864 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLEQ07864 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLEQ07864 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLEQ07864 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
POLEQ07864 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLEQ07864 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
POLEQ07864 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLEQ07864 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
POLEQ07864 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLEQ07864 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLEQ07864 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLEQ07864 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLEQ07864 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLEQ07864 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLEQ07864 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLEQ07864 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLEQ07864 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLEQ07864 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLEQ07864 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLEQ07864 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms