Protein–RNA interactions for Protein: Q07343

PDE4B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4B, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4BQ07343 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDE4BQ07343 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDE4BQ07343 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDE4BQ07343 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDE4BQ07343 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PDE4BQ07343 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDE4BQ07343 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDE4BQ07343 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDE4BQ07343 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDE4BQ07343 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDE4BQ07343 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDE4BQ07343 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDE4BQ07343 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDE4BQ07343 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDE4BQ07343 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDE4BQ07343 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDE4BQ07343 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDE4BQ07343 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDE4BQ07343 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDE4BQ07343 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDE4BQ07343 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDE4BQ07343 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDE4BQ07343 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDE4BQ07343 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDE4BQ07343 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PDE4BQ07343 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDE4BQ07343 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDE4BQ07343 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDE4BQ07343 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDE4BQ07343 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDE4BQ07343 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDE4BQ07343 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDE4BQ07343 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDE4BQ07343 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDE4BQ07343 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDE4BQ07343 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDE4BQ07343 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDE4BQ07343 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PDE4BQ07343 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDE4BQ07343 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDE4BQ07343 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDE4BQ07343 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDE4BQ07343 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDE4BQ07343 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDE4BQ07343 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDE4BQ07343 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDE4BQ07343 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDE4BQ07343 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDE4BQ07343 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE4BQ07343 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE4BQ07343 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE4BQ07343 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE4BQ07343 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE4BQ07343 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE4BQ07343 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE4BQ07343 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE4BQ07343 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE4BQ07343 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE4BQ07343 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE4BQ07343 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE4BQ07343 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE4BQ07343 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE4BQ07343 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE4BQ07343 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE4BQ07343 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE4BQ07343 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE4BQ07343 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDE4BQ07343 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDE4BQ07343 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDE4BQ07343 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDE4BQ07343 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDE4BQ07343 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDE4BQ07343 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDE4BQ07343 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDE4BQ07343 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDE4BQ07343 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDE4BQ07343 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PDE4BQ07343 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDE4BQ07343 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDE4BQ07343 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PDE4BQ07343 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PDE4BQ07343 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
PDE4BQ07343 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PDE4BQ07343 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PDE4BQ07343 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDE4BQ07343 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PDE4BQ07343 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDE4BQ07343 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PDE4BQ07343 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDE4BQ07343 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDE4BQ07343 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDE4BQ07343 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDE4BQ07343 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDE4BQ07343 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDE4BQ07343 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDE4BQ07343 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PDE4BQ07343 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDE4BQ07343 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE4BQ07343 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE4BQ07343 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms