Protein–RNA interactions for Protein: Q06643

LTB, Lymphotoxin-beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBQ06643 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LTBQ06643 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LTBQ06643 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
LTBQ06643 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LTBQ06643 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LTBQ06643 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LTBQ06643 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LTBQ06643 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LTBQ06643 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LTBQ06643 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LTBQ06643 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LTBQ06643 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LTBQ06643 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LTBQ06643 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LTBQ06643 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LTBQ06643 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LTBQ06643 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LTBQ06643 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LTBQ06643 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LTBQ06643 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
LTBQ06643 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
LTBQ06643 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LTBQ06643 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LTBQ06643 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LTBQ06643 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LTBQ06643 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LTBQ06643 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LTBQ06643 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
LTBQ06643 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LTBQ06643 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LTBQ06643 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LTBQ06643 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LTBQ06643 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LTBQ06643 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LTBQ06643 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LTBQ06643 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LTBQ06643 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LTBQ06643 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LTBQ06643 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LTBQ06643 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LTBQ06643 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LTBQ06643 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LTBQ06643 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LTBQ06643 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LTBQ06643 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LTBQ06643 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LTBQ06643 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LTBQ06643 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LTBQ06643 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LTBQ06643 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LTBQ06643 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
LTBQ06643 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LTBQ06643 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LTBQ06643 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LTBQ06643 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LTBQ06643 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LTBQ06643 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LTBQ06643 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LTBQ06643 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LTBQ06643 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LTBQ06643 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LTBQ06643 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LTBQ06643 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
LTBQ06643 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LTBQ06643 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LTBQ06643 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LTBQ06643 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LTBQ06643 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LTBQ06643 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LTBQ06643 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
LTBQ06643 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LTBQ06643 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LTBQ06643 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LTBQ06643 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LTBQ06643 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LTBQ06643 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LTBQ06643 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LTBQ06643 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LTBQ06643 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LTBQ06643 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LTBQ06643 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LTBQ06643 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LTBQ06643 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LTBQ06643 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LTBQ06643 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LTBQ06643 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LTBQ06643 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LTBQ06643 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LTBQ06643 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LTBQ06643 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LTBQ06643 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LTBQ06643 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LTBQ06643 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LTBQ06643 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LTBQ06643 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
LTBQ06643 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LTBQ06643 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LTBQ06643 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
LTBQ06643 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LTBQ06643 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms