Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PSME1Q06323 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PSME1Q06323 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PSME1Q06323 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
PSME1Q06323 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
PSME1Q06323 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
PSME1Q06323 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
PSME1Q06323 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PSME1Q06323 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
PSME1Q06323 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PSME1Q06323 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PSME1Q06323 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PSME1Q06323 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PSME1Q06323 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PSME1Q06323 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PSME1Q06323 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PSME1Q06323 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PSME1Q06323 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
PSME1Q06323 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PSME1Q06323 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PSME1Q06323 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PSME1Q06323 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PSME1Q06323 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PSME1Q06323 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PSME1Q06323 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
PSME1Q06323 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
PSME1Q06323 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PSME1Q06323 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PSME1Q06323 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PSME1Q06323 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PSME1Q06323 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PSME1Q06323 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PSME1Q06323 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PSME1Q06323 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PSME1Q06323 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PSME1Q06323 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PSME1Q06323 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
PSME1Q06323 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PSME1Q06323 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PSME1Q06323 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PSME1Q06323 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PSME1Q06323 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PSME1Q06323 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PSME1Q06323 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PSME1Q06323 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PSME1Q06323 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
PSME1Q06323 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PSME1Q06323 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PSME1Q06323 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PSME1Q06323 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PSME1Q06323 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PSME1Q06323 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PSME1Q06323 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PSME1Q06323 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PSME1Q06323 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PSME1Q06323 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PSME1Q06323 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PSME1Q06323 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PSME1Q06323 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PSME1Q06323 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PSME1Q06323 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PSME1Q06323 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PSME1Q06323 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PSME1Q06323 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PSME1Q06323 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PSME1Q06323 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PSME1Q06323 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PSME1Q06323 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PSME1Q06323 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PSME1Q06323 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PSME1Q06323 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PSME1Q06323 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PSME1Q06323 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
PSME1Q06323 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
PSME1Q06323 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PSME1Q06323 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PSME1Q06323 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PSME1Q06323 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PSME1Q06323 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PSME1Q06323 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
PSME1Q06323 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PSME1Q06323 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PSME1Q06323 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PSME1Q06323 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PSME1Q06323 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PSME1Q06323 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PSME1Q06323 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PSME1Q06323 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PSME1Q06323 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PSME1Q06323 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PSME1Q06323 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
PSME1Q06323 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PSME1Q06323 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PSME1Q06323 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PSME1Q06323 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PSME1Q06323 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PSME1Q06323 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PSME1Q06323 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PSME1Q06323 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PSME1Q06323 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms