Protein–RNA interactions for Protein: Q05086

UBE3A, Ubiquitin-protein ligase E3A, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3AQ05086 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
UBE3AQ05086 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
UBE3AQ05086 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
UBE3AQ05086 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
UBE3AQ05086 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
UBE3AQ05086 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
UBE3AQ05086 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
UBE3AQ05086 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
UBE3AQ05086 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
UBE3AQ05086 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
UBE3AQ05086 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
UBE3AQ05086 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
UBE3AQ05086 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
UBE3AQ05086 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
UBE3AQ05086 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
UBE3AQ05086 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
UBE3AQ05086 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
UBE3AQ05086 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
UBE3AQ05086 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
UBE3AQ05086 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
UBE3AQ05086 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
UBE3AQ05086 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
UBE3AQ05086 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
UBE3AQ05086 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
UBE3AQ05086 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
UBE3AQ05086 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
UBE3AQ05086 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
UBE3AQ05086 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
UBE3AQ05086 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
UBE3AQ05086 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
UBE3AQ05086 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
UBE3AQ05086 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
UBE3AQ05086 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
UBE3AQ05086 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
UBE3AQ05086 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
UBE3AQ05086 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
UBE3AQ05086 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
UBE3AQ05086 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
UBE3AQ05086 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
UBE3AQ05086 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
UBE3AQ05086 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
UBE3AQ05086 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
UBE3AQ05086 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
UBE3AQ05086 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
UBE3AQ05086 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
UBE3AQ05086 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
UBE3AQ05086 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
UBE3AQ05086 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
UBE3AQ05086 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
UBE3AQ05086 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
UBE3AQ05086 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
UBE3AQ05086 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
UBE3AQ05086 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
UBE3AQ05086 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
UBE3AQ05086 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
UBE3AQ05086 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
UBE3AQ05086 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
UBE3AQ05086 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
UBE3AQ05086 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
UBE3AQ05086 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
UBE3AQ05086 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
UBE3AQ05086 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
UBE3AQ05086 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
UBE3AQ05086 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
UBE3AQ05086 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
UBE3AQ05086 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
UBE3AQ05086 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
UBE3AQ05086 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
UBE3AQ05086 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
UBE3AQ05086 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
UBE3AQ05086 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
UBE3AQ05086 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
UBE3AQ05086 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
UBE3AQ05086 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
UBE3AQ05086 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
UBE3AQ05086 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
UBE3AQ05086 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
UBE3AQ05086 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
UBE3AQ05086 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
UBE3AQ05086 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
UBE3AQ05086 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
UBE3AQ05086 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
UBE3AQ05086 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
UBE3AQ05086 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
UBE3AQ05086 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
UBE3AQ05086 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
UBE3AQ05086 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
UBE3AQ05086 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
UBE3AQ05086 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
UBE3AQ05086 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
UBE3AQ05086 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
UBE3AQ05086 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
UBE3AQ05086 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
UBE3AQ05086 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
UBE3AQ05086 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
UBE3AQ05086 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
UBE3AQ05086 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
UBE3AQ05086 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
UBE3AQ05086 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
UBE3AQ05086 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms