Protein–RNA interactions for Protein: Q02742

GCNT1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT1Q02742 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GCNT1Q02742 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GCNT1Q02742 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GCNT1Q02742 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
GCNT1Q02742 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GCNT1Q02742 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GCNT1Q02742 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GCNT1Q02742 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GCNT1Q02742 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GCNT1Q02742 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GCNT1Q02742 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GCNT1Q02742 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GCNT1Q02742 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GCNT1Q02742 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GCNT1Q02742 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GCNT1Q02742 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GCNT1Q02742 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GCNT1Q02742 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GCNT1Q02742 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GCNT1Q02742 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GCNT1Q02742 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GCNT1Q02742 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GCNT1Q02742 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GCNT1Q02742 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GCNT1Q02742 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GCNT1Q02742 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GCNT1Q02742 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GCNT1Q02742 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GCNT1Q02742 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GCNT1Q02742 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GCNT1Q02742 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GCNT1Q02742 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GCNT1Q02742 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GCNT1Q02742 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GCNT1Q02742 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GCNT1Q02742 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GCNT1Q02742 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GCNT1Q02742 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GCNT1Q02742 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GCNT1Q02742 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GCNT1Q02742 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GCNT1Q02742 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GCNT1Q02742 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GCNT1Q02742 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GCNT1Q02742 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GCNT1Q02742 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GCNT1Q02742 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GCNT1Q02742 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GCNT1Q02742 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GCNT1Q02742 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GCNT1Q02742 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GCNT1Q02742 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GCNT1Q02742 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GCNT1Q02742 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GCNT1Q02742 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GCNT1Q02742 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GCNT1Q02742 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GCNT1Q02742 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GCNT1Q02742 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GCNT1Q02742 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GCNT1Q02742 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GCNT1Q02742 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GCNT1Q02742 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GCNT1Q02742 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GCNT1Q02742 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GCNT1Q02742 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GCNT1Q02742 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GCNT1Q02742 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GCNT1Q02742 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GCNT1Q02742 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GCNT1Q02742 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GCNT1Q02742 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GCNT1Q02742 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GCNT1Q02742 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GCNT1Q02742 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GCNT1Q02742 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GCNT1Q02742 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GCNT1Q02742 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GCNT1Q02742 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GCNT1Q02742 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GCNT1Q02742 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GCNT1Q02742 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GCNT1Q02742 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GCNT1Q02742 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GCNT1Q02742 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
GCNT1Q02742 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GCNT1Q02742 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GCNT1Q02742 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GCNT1Q02742 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GCNT1Q02742 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GCNT1Q02742 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GCNT1Q02742 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GCNT1Q02742 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GCNT1Q02742 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
GCNT1Q02742 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GCNT1Q02742 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GCNT1Q02742 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GCNT1Q02742 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GCNT1Q02742 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GCNT1Q02742 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms