Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNB1Q02641 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNB1Q02641 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNB1Q02641 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNB1Q02641 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNB1Q02641 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNB1Q02641 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNB1Q02641 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNB1Q02641 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNB1Q02641 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNB1Q02641 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNB1Q02641 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNB1Q02641 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNB1Q02641 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CACNB1Q02641 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CACNB1Q02641 AC096656.1-201ENST00000623826 1364 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
CACNB1Q02641 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CACNB1Q02641 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CACNB1Q02641 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CACNB1Q02641 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CACNB1Q02641 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CACNB1Q02641 DAB1-AS1-201ENST00000416598 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CACNB1Q02641 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CACNB1Q02641 LINC01378-202ENST00000437514 783 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CACNB1Q02641 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CACNB1Q02641 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CACNB1Q02641 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CACNB1Q02641 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CACNB1Q02641 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CACNB1Q02641 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CACNB1Q02641 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CACNB1Q02641 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CACNB1Q02641 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CACNB1Q02641 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNB1Q02641 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNB1Q02641 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNB1Q02641 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNB1Q02641 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNB1Q02641 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNB1Q02641 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNB1Q02641 KRT8P2-201ENST00000556193 944 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNB1Q02641 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNB1Q02641 AC008592.5-201ENST00000607856 547 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNB1Q02641 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNB1Q02641 LINC01125-249ENST00000627399 1067 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNB1Q02641 RFC1-217ENST00000639695 867 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNB1Q02641 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNB1Q02641 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNB1Q02641 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNB1Q02641 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNB1Q02641 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNB1Q02641 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNB1Q02641 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNB1Q02641 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNB1Q02641 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNB1Q02641 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNB1Q02641 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNB1Q02641 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNB1Q02641 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNB1Q02641 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNB1Q02641 VN1R53P-201ENST00000429536 957 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNB1Q02641 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNB1Q02641 AC010181.2-201ENST00000483759 482 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNB1Q02641 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNB1Q02641 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNB1Q02641 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNB1Q02641 AL357094.1-201ENST00000603845 844 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNB1Q02641 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNB1Q02641 SYNJ2BP-COX16-205ENST00000621525 929 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNB1Q02641 SNHG5-213ENST00000622963 753 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNB1Q02641 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNB1Q02641 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNB1Q02641 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNB1Q02641 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNB1Q02641 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNB1Q02641 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNB1Q02641 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNB1Q02641 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNB1Q02641 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNB1Q02641 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNB1Q02641 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNB1Q02641 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNB1Q02641 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNB1Q02641 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNB1Q02641 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNB1Q02641 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNB1Q02641 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNB1Q02641 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNB1Q02641 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNB1Q02641 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNB1Q02641 AP000280.1-201ENST00000624800 832 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNB1Q02641 AL445984.1-201ENST00000637834 659 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNB1Q02641 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNB1Q02641 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNB1Q02641 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNB1Q02641 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNB1Q02641 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CACNB1Q02641 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CACNB1Q02641 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CACNB1Q02641 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms