Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CENPEQ02224 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CENPEQ02224 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CENPEQ02224 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CENPEQ02224 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CENPEQ02224 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CENPEQ02224 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CENPEQ02224 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CENPEQ02224 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CENPEQ02224 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CENPEQ02224 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CENPEQ02224 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CENPEQ02224 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CENPEQ02224 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CENPEQ02224 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CENPEQ02224 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CENPEQ02224 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CENPEQ02224 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CENPEQ02224 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CENPEQ02224 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CENPEQ02224 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CENPEQ02224 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CENPEQ02224 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CENPEQ02224 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CENPEQ02224 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CENPEQ02224 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CENPEQ02224 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CENPEQ02224 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CENPEQ02224 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CENPEQ02224 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CENPEQ02224 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CENPEQ02224 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CENPEQ02224 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CENPEQ02224 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CENPEQ02224 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CENPEQ02224 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CENPEQ02224 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CENPEQ02224 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CENPEQ02224 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CENPEQ02224 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CENPEQ02224 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CENPEQ02224 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CENPEQ02224 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CENPEQ02224 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CENPEQ02224 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CENPEQ02224 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CENPEQ02224 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CENPEQ02224 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CENPEQ02224 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CENPEQ02224 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CENPEQ02224 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CENPEQ02224 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CENPEQ02224 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CENPEQ02224 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CENPEQ02224 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CENPEQ02224 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CENPEQ02224 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CENPEQ02224 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CENPEQ02224 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CENPEQ02224 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CENPEQ02224 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CENPEQ02224 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CENPEQ02224 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CENPEQ02224 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CENPEQ02224 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CENPEQ02224 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CENPEQ02224 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CENPEQ02224 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CENPEQ02224 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CENPEQ02224 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CENPEQ02224 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CENPEQ02224 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CENPEQ02224 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CENPEQ02224 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CENPEQ02224 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CENPEQ02224 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CENPEQ02224 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CENPEQ02224 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CENPEQ02224 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CENPEQ02224 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CENPEQ02224 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CENPEQ02224 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CENPEQ02224 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CENPEQ02224 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CENPEQ02224 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CENPEQ02224 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CENPEQ02224 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CENPEQ02224 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CENPEQ02224 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CENPEQ02224 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CENPEQ02224 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CENPEQ02224 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CENPEQ02224 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CENPEQ02224 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CENPEQ02224 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CENPEQ02224 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CENPEQ02224 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CENPEQ02224 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CENPEQ02224 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CENPEQ02224 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms