Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT1

PRCD, Progressive rod-cone degeneration protein, humanhuman

Predictions only

Length 54 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRCDQ00LT1 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRCDQ00LT1 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRCDQ00LT1 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRCDQ00LT1 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRCDQ00LT1 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRCDQ00LT1 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRCDQ00LT1 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRCDQ00LT1 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRCDQ00LT1 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRCDQ00LT1 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRCDQ00LT1 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRCDQ00LT1 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PRCDQ00LT1 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PRCDQ00LT1 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PRCDQ00LT1 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PRCDQ00LT1 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PRCDQ00LT1 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PRCDQ00LT1 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PRCDQ00LT1 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PRCDQ00LT1 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PRCDQ00LT1 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PRCDQ00LT1 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PRCDQ00LT1 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PRCDQ00LT1 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PRCDQ00LT1 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PRCDQ00LT1 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PRCDQ00LT1 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PRCDQ00LT1 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PRCDQ00LT1 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PRCDQ00LT1 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PRCDQ00LT1 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PRCDQ00LT1 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PRCDQ00LT1 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PRCDQ00LT1 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PRCDQ00LT1 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PRCDQ00LT1 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PRCDQ00LT1 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PRCDQ00LT1 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PRCDQ00LT1 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PRCDQ00LT1 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PRCDQ00LT1 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PRCDQ00LT1 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PRCDQ00LT1 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PRCDQ00LT1 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PRCDQ00LT1 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRCDQ00LT1 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PRCDQ00LT1 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRCDQ00LT1 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRCDQ00LT1 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRCDQ00LT1 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRCDQ00LT1 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRCDQ00LT1 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRCDQ00LT1 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRCDQ00LT1 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRCDQ00LT1 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRCDQ00LT1 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRCDQ00LT1 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRCDQ00LT1 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRCDQ00LT1 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PRCDQ00LT1 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRCDQ00LT1 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRCDQ00LT1 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRCDQ00LT1 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PRCDQ00LT1 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PRCDQ00LT1 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PRCDQ00LT1 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRCDQ00LT1 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRCDQ00LT1 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRCDQ00LT1 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRCDQ00LT1 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRCDQ00LT1 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRCDQ00LT1 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRCDQ00LT1 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRCDQ00LT1 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PRCDQ00LT1 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRCDQ00LT1 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRCDQ00LT1 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRCDQ00LT1 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRCDQ00LT1 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRCDQ00LT1 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRCDQ00LT1 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRCDQ00LT1 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRCDQ00LT1 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRCDQ00LT1 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRCDQ00LT1 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRCDQ00LT1 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRCDQ00LT1 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRCDQ00LT1 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRCDQ00LT1 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRCDQ00LT1 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRCDQ00LT1 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRCDQ00LT1 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PRCDQ00LT1 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRCDQ00LT1 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRCDQ00LT1 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRCDQ00LT1 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRCDQ00LT1 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PRCDQ00LT1 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRCDQ00LT1 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRCDQ00LT1 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms