Protein–RNA interactions for Protein: P98194

ATP2C1, Calcium-transporting ATPase type 2C member 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2C1P98194 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP2C1P98194 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP2C1P98194 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP2C1P98194 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP2C1P98194 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP2C1P98194 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP2C1P98194 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP2C1P98194 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP2C1P98194 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP2C1P98194 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP2C1P98194 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP2C1P98194 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP2C1P98194 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP2C1P98194 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP2C1P98194 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP2C1P98194 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP2C1P98194 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP2C1P98194 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP2C1P98194 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP2C1P98194 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP2C1P98194 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP2C1P98194 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP2C1P98194 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP2C1P98194 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP2C1P98194 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP2C1P98194 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP2C1P98194 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP2C1P98194 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP2C1P98194 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP2C1P98194 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP2C1P98194 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP2C1P98194 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP2C1P98194 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP2C1P98194 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP2C1P98194 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP2C1P98194 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP2C1P98194 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP2C1P98194 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP2C1P98194 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP2C1P98194 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP2C1P98194 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP2C1P98194 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP2C1P98194 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP2C1P98194 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP2C1P98194 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP2C1P98194 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP2C1P98194 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP2C1P98194 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP2C1P98194 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP2C1P98194 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP2C1P98194 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP2C1P98194 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP2C1P98194 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP2C1P98194 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP2C1P98194 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP2C1P98194 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP2C1P98194 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP2C1P98194 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP2C1P98194 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP2C1P98194 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP2C1P98194 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP2C1P98194 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP2C1P98194 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP2C1P98194 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP2C1P98194 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP2C1P98194 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP2C1P98194 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP2C1P98194 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP2C1P98194 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP2C1P98194 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP2C1P98194 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP2C1P98194 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP2C1P98194 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP2C1P98194 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP2C1P98194 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP2C1P98194 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP2C1P98194 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP2C1P98194 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP2C1P98194 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP2C1P98194 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP2C1P98194 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP2C1P98194 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP2C1P98194 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP2C1P98194 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP2C1P98194 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP2C1P98194 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP2C1P98194 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP2C1P98194 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP2C1P98194 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP2C1P98194 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP2C1P98194 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP2C1P98194 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP2C1P98194 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP2C1P98194 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP2C1P98194 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP2C1P98194 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP2C1P98194 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP2C1P98194 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP2C1P98194 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP2C1P98194 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms