Protein–RNA interactions for Protein: P98155

VLDLR, Very low-density lipoprotein receptor, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VLDLRP98155 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VLDLRP98155 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VLDLRP98155 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VLDLRP98155 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VLDLRP98155 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VLDLRP98155 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VLDLRP98155 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VLDLRP98155 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VLDLRP98155 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VLDLRP98155 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VLDLRP98155 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VLDLRP98155 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VLDLRP98155 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VLDLRP98155 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VLDLRP98155 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VLDLRP98155 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
VLDLRP98155 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VLDLRP98155 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VLDLRP98155 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VLDLRP98155 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VLDLRP98155 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VLDLRP98155 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VLDLRP98155 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VLDLRP98155 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
VLDLRP98155 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
VLDLRP98155 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VLDLRP98155 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VLDLRP98155 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VLDLRP98155 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VLDLRP98155 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VLDLRP98155 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VLDLRP98155 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VLDLRP98155 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VLDLRP98155 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VLDLRP98155 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VLDLRP98155 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VLDLRP98155 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VLDLRP98155 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VLDLRP98155 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VLDLRP98155 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
VLDLRP98155 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VLDLRP98155 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VLDLRP98155 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VLDLRP98155 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VLDLRP98155 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VLDLRP98155 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VLDLRP98155 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VLDLRP98155 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VLDLRP98155 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VLDLRP98155 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VLDLRP98155 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VLDLRP98155 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VLDLRP98155 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VLDLRP98155 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VLDLRP98155 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VLDLRP98155 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VLDLRP98155 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VLDLRP98155 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VLDLRP98155 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VLDLRP98155 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VLDLRP98155 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VLDLRP98155 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VLDLRP98155 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VLDLRP98155 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VLDLRP98155 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VLDLRP98155 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VLDLRP98155 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VLDLRP98155 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VLDLRP98155 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VLDLRP98155 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VLDLRP98155 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VLDLRP98155 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VLDLRP98155 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VLDLRP98155 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VLDLRP98155 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VLDLRP98155 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VLDLRP98155 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VLDLRP98155 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VLDLRP98155 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VLDLRP98155 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VLDLRP98155 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VLDLRP98155 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
VLDLRP98155 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VLDLRP98155 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
VLDLRP98155 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VLDLRP98155 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VLDLRP98155 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VLDLRP98155 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VLDLRP98155 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VLDLRP98155 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VLDLRP98155 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VLDLRP98155 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VLDLRP98155 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VLDLRP98155 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VLDLRP98155 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VLDLRP98155 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VLDLRP98155 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VLDLRP98155 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VLDLRP98155 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VLDLRP98155 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms