Protein–RNA interactions for Protein: P82279

CRB1, Protein crumbs homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB1P82279 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CRB1P82279 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CRB1P82279 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CRB1P82279 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CRB1P82279 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CRB1P82279 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CRB1P82279 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CRB1P82279 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CRB1P82279 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CRB1P82279 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CRB1P82279 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.84
CRB1P82279 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CRB1P82279 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CRB1P82279 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CRB1P82279 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CRB1P82279 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CRB1P82279 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CRB1P82279 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CRB1P82279 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CRB1P82279 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CRB1P82279 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CRB1P82279 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CRB1P82279 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CRB1P82279 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CRB1P82279 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CRB1P82279 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
CRB1P82279 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CRB1P82279 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CRB1P82279 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CRB1P82279 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CRB1P82279 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CRB1P82279 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CRB1P82279 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CRB1P82279 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CRB1P82279 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
CRB1P82279 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CRB1P82279 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CRB1P82279 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CRB1P82279 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
CRB1P82279 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CRB1P82279 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CRB1P82279 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CRB1P82279 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CRB1P82279 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CRB1P82279 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CRB1P82279 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CRB1P82279 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CRB1P82279 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CRB1P82279 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CRB1P82279 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CRB1P82279 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CRB1P82279 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CRB1P82279 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CRB1P82279 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CRB1P82279 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CRB1P82279 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CRB1P82279 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CRB1P82279 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CRB1P82279 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CRB1P82279 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CRB1P82279 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CRB1P82279 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CRB1P82279 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CRB1P82279 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
CRB1P82279 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CRB1P82279 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CRB1P82279 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CRB1P82279 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CRB1P82279 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CRB1P82279 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CRB1P82279 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CRB1P82279 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CRB1P82279 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CRB1P82279 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
CRB1P82279 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CRB1P82279 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CRB1P82279 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CRB1P82279 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
CRB1P82279 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CRB1P82279 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
CRB1P82279 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CRB1P82279 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CRB1P82279 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CRB1P82279 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CRB1P82279 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CRB1P82279 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CRB1P82279 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CRB1P82279 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CRB1P82279 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CRB1P82279 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CRB1P82279 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CRB1P82279 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CRB1P82279 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CRB1P82279 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CRB1P82279 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CRB1P82279 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CRB1P82279 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CRB1P82279 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CRB1P82279 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CRB1P82279 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms