Protein–RNA interactions for Protein: P78312

FAM193A, Protein FAM193A, humanhuman

Predictions only

Length 1,265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM193AP78312 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM193AP78312 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM193AP78312 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM193AP78312 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM193AP78312 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM193AP78312 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM193AP78312 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM193AP78312 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM193AP78312 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM193AP78312 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM193AP78312 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM193AP78312 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM193AP78312 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM193AP78312 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM193AP78312 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM193AP78312 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM193AP78312 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM193AP78312 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM193AP78312 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM193AP78312 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM193AP78312 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM193AP78312 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM193AP78312 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM193AP78312 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM193AP78312 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM193AP78312 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM193AP78312 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM193AP78312 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM193AP78312 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM193AP78312 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM193AP78312 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM193AP78312 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM193AP78312 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM193AP78312 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM193AP78312 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM193AP78312 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM193AP78312 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM193AP78312 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM193AP78312 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM193AP78312 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM193AP78312 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM193AP78312 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM193AP78312 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM193AP78312 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM193AP78312 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM193AP78312 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM193AP78312 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM193AP78312 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM193AP78312 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM193AP78312 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM193AP78312 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM193AP78312 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM193AP78312 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM193AP78312 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM193AP78312 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM193AP78312 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM193AP78312 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM193AP78312 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM193AP78312 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM193AP78312 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM193AP78312 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM193AP78312 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM193AP78312 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM193AP78312 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM193AP78312 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM193AP78312 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM193AP78312 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FAM193AP78312 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
FAM193AP78312 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FAM193AP78312 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
FAM193AP78312 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FAM193AP78312 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FAM193AP78312 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FAM193AP78312 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FAM193AP78312 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FAM193AP78312 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FAM193AP78312 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM193AP78312 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM193AP78312 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM193AP78312 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM193AP78312 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM193AP78312 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM193AP78312 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM193AP78312 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM193AP78312 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM193AP78312 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM193AP78312 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM193AP78312 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM193AP78312 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM193AP78312 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM193AP78312 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM193AP78312 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM193AP78312 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM193AP78312 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM193AP78312 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM193AP78312 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM193AP78312 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM193AP78312 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM193AP78312 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM193AP78312 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms