Protein–RNA interactions for Protein: P67936

TPM4, Tropomyosin alpha-4 chain, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM4P67936 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TPM4P67936 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TPM4P67936 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TPM4P67936 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TPM4P67936 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TPM4P67936 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TPM4P67936 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TPM4P67936 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TPM4P67936 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TPM4P67936 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TPM4P67936 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TPM4P67936 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TPM4P67936 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TPM4P67936 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TPM4P67936 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TPM4P67936 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TPM4P67936 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TPM4P67936 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TPM4P67936 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TPM4P67936 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TPM4P67936 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TPM4P67936 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TPM4P67936 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TPM4P67936 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TPM4P67936 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TPM4P67936 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TPM4P67936 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TPM4P67936 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TPM4P67936 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TPM4P67936 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TPM4P67936 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TPM4P67936 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TPM4P67936 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TPM4P67936 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TPM4P67936 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TPM4P67936 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TPM4P67936 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TPM4P67936 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TPM4P67936 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TPM4P67936 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TPM4P67936 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TPM4P67936 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TPM4P67936 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TPM4P67936 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TPM4P67936 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TPM4P67936 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TPM4P67936 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TPM4P67936 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TPM4P67936 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TPM4P67936 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TPM4P67936 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TPM4P67936 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TPM4P67936 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TPM4P67936 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TPM4P67936 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TPM4P67936 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TPM4P67936 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TPM4P67936 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TPM4P67936 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TPM4P67936 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TPM4P67936 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TPM4P67936 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TPM4P67936 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TPM4P67936 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TPM4P67936 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TPM4P67936 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TPM4P67936 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TPM4P67936 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TPM4P67936 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TPM4P67936 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TPM4P67936 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TPM4P67936 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TPM4P67936 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TPM4P67936 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TPM4P67936 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TPM4P67936 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TPM4P67936 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TPM4P67936 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TPM4P67936 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TPM4P67936 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TPM4P67936 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TPM4P67936 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TPM4P67936 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TPM4P67936 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TPM4P67936 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TPM4P67936 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TPM4P67936 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TPM4P67936 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TPM4P67936 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TPM4P67936 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TPM4P67936 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TPM4P67936 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TPM4P67936 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TPM4P67936 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TPM4P67936 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TPM4P67936 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TPM4P67936 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TPM4P67936 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TPM4P67936 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TPM4P67936 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms