Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RPS29P62273 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RPS29P62273 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RPS29P62273 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
RPS29P62273 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RPS29P62273 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RPS29P62273 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RPS29P62273 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
RPS29P62273 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC11.3□□□□□ -0.6
RPS29P62273 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
RPS29P62273 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
RPS29P62273 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC11.3□□□□□ -0.6
RPS29P62273 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
RPS29P62273 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
RPS29P62273 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
RPS29P62273 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RPS29P62273 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
RPS29P62273 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RPS29P62273 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RPS29P62273 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RPS29P62273 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
RPS29P62273 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
RPS29P62273 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
RPS29P62273 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RPS29P62273 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RPS29P62273 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
RPS29P62273 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RPS29P62273 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RPS29P62273 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RPS29P62273 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RPS29P62273 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RPS29P62273 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RPS29P62273 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
RPS29P62273 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RPS29P62273 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
RPS29P62273 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
RPS29P62273 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
RPS29P62273 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
RPS29P62273 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
RPS29P62273 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
RPS29P62273 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
RPS29P62273 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
RPS29P62273 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
RPS29P62273 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
RPS29P62273 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
RPS29P62273 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
RPS29P62273 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
RPS29P62273 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
RPS29P62273 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
RPS29P62273 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
RPS29P62273 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
RPS29P62273 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
RPS29P62273 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
RPS29P62273 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
RPS29P62273 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
RPS29P62273 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
RPS29P62273 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
RPS29P62273 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
RPS29P62273 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
RPS29P62273 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
RPS29P62273 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
RPS29P62273 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
RPS29P62273 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
RPS29P62273 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RPS29P62273 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RPS29P62273 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RPS29P62273 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
RPS29P62273 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
RPS29P62273 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
RPS29P62273 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
RPS29P62273 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
RPS29P62273 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
RPS29P62273 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
RPS29P62273 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RPS29P62273 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RPS29P62273 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
RPS29P62273 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
RPS29P62273 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RPS29P62273 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
RPS29P62273 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RPS29P62273 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
RPS29P62273 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
RPS29P62273 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
RPS29P62273 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
RPS29P62273 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
RPS29P62273 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC11.28□□□□□ -0.6
RPS29P62273 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
RPS29P62273 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
RPS29P62273 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
RPS29P62273 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RPS29P62273 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
RPS29P62273 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RPS29P62273 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RPS29P62273 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RPS29P62273 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
RPS29P62273 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
RPS29P62273 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RPS29P62273 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RPS29P62273 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RPS29P62273 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
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