Protein–RNA interactions for Protein: P55327

TPD52, Tumor protein D52, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPD52P55327 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TPD52P55327 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TPD52P55327 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TPD52P55327 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TPD52P55327 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TPD52P55327 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TPD52P55327 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TPD52P55327 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TPD52P55327 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TPD52P55327 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TPD52P55327 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TPD52P55327 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TPD52P55327 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
TPD52P55327 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TPD52P55327 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TPD52P55327 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
TPD52P55327 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TPD52P55327 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TPD52P55327 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TPD52P55327 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TPD52P55327 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TPD52P55327 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TPD52P55327 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TPD52P55327 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TPD52P55327 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TPD52P55327 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TPD52P55327 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TPD52P55327 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TPD52P55327 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
TPD52P55327 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TPD52P55327 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TPD52P55327 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TPD52P55327 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC19■□□□□ 0.63
TPD52P55327 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TPD52P55327 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TPD52P55327 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TPD52P55327 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TPD52P55327 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TPD52P55327 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TPD52P55327 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TPD52P55327 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TPD52P55327 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TPD52P55327 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TPD52P55327 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TPD52P55327 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TPD52P55327 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TPD52P55327 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TPD52P55327 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TPD52P55327 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TPD52P55327 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TPD52P55327 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TPD52P55327 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TPD52P55327 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TPD52P55327 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TPD52P55327 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TPD52P55327 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TPD52P55327 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TPD52P55327 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TPD52P55327 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TPD52P55327 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
TPD52P55327 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
TPD52P55327 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TPD52P55327 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TPD52P55327 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TPD52P55327 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TPD52P55327 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TPD52P55327 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TPD52P55327 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TPD52P55327 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TPD52P55327 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TPD52P55327 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TPD52P55327 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TPD52P55327 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TPD52P55327 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TPD52P55327 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TPD52P55327 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TPD52P55327 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TPD52P55327 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TPD52P55327 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TPD52P55327 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TPD52P55327 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TPD52P55327 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TPD52P55327 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TPD52P55327 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TPD52P55327 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TPD52P55327 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TPD52P55327 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TPD52P55327 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TPD52P55327 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TPD52P55327 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TPD52P55327 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TPD52P55327 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TPD52P55327 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TPD52P55327 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TPD52P55327 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TPD52P55327 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TPD52P55327 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TPD52P55327 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TPD52P55327 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TPD52P55327 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms