Protein–RNA interactions for Protein: P54709

ATP1B3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1B3P54709 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP1B3P54709 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP1B3P54709 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP1B3P54709 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP1B3P54709 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP1B3P54709 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP1B3P54709 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP1B3P54709 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP1B3P54709 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP1B3P54709 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP1B3P54709 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP1B3P54709 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP1B3P54709 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP1B3P54709 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP1B3P54709 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP1B3P54709 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP1B3P54709 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP1B3P54709 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP1B3P54709 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP1B3P54709 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP1B3P54709 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP1B3P54709 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP1B3P54709 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP1B3P54709 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP1B3P54709 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP1B3P54709 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP1B3P54709 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP1B3P54709 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP1B3P54709 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP1B3P54709 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP1B3P54709 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP1B3P54709 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP1B3P54709 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP1B3P54709 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP1B3P54709 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP1B3P54709 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP1B3P54709 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP1B3P54709 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP1B3P54709 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP1B3P54709 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP1B3P54709 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP1B3P54709 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP1B3P54709 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP1B3P54709 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP1B3P54709 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP1B3P54709 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP1B3P54709 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP1B3P54709 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP1B3P54709 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP1B3P54709 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP1B3P54709 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP1B3P54709 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP1B3P54709 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP1B3P54709 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP1B3P54709 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP1B3P54709 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP1B3P54709 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP1B3P54709 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP1B3P54709 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP1B3P54709 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP1B3P54709 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP1B3P54709 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP1B3P54709 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP1B3P54709 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP1B3P54709 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP1B3P54709 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP1B3P54709 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP1B3P54709 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP1B3P54709 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP1B3P54709 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP1B3P54709 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP1B3P54709 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP1B3P54709 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP1B3P54709 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP1B3P54709 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP1B3P54709 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP1B3P54709 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP1B3P54709 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP1B3P54709 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP1B3P54709 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP1B3P54709 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP1B3P54709 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP1B3P54709 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP1B3P54709 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP1B3P54709 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP1B3P54709 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP1B3P54709 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP1B3P54709 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP1B3P54709 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP1B3P54709 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP1B3P54709 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP1B3P54709 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP1B3P54709 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP1B3P54709 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP1B3P54709 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP1B3P54709 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP1B3P54709 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP1B3P54709 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP1B3P54709 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP1B3P54709 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms