Protein–RNA interactions for Protein: P54707

ATP12A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP12AP54707 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP12AP54707 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP12AP54707 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP12AP54707 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP12AP54707 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP12AP54707 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP12AP54707 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP12AP54707 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP12AP54707 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP12AP54707 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP12AP54707 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP12AP54707 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP12AP54707 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP12AP54707 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP12AP54707 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP12AP54707 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP12AP54707 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP12AP54707 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP12AP54707 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP12AP54707 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP12AP54707 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP12AP54707 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP12AP54707 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP12AP54707 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP12AP54707 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP12AP54707 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP12AP54707 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP12AP54707 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP12AP54707 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP12AP54707 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP12AP54707 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP12AP54707 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP12AP54707 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP12AP54707 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP12AP54707 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP12AP54707 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP12AP54707 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP12AP54707 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP12AP54707 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP12AP54707 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP12AP54707 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP12AP54707 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP12AP54707 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP12AP54707 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP12AP54707 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP12AP54707 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP12AP54707 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP12AP54707 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP12AP54707 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP12AP54707 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP12AP54707 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP12AP54707 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP12AP54707 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP12AP54707 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP12AP54707 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP12AP54707 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP12AP54707 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP12AP54707 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP12AP54707 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP12AP54707 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP12AP54707 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP12AP54707 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP12AP54707 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP12AP54707 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP12AP54707 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP12AP54707 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP12AP54707 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP12AP54707 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP12AP54707 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP12AP54707 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP12AP54707 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP12AP54707 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP12AP54707 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP12AP54707 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP12AP54707 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP12AP54707 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP12AP54707 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP12AP54707 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP12AP54707 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP12AP54707 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP12AP54707 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP12AP54707 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP12AP54707 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP12AP54707 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP12AP54707 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP12AP54707 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP12AP54707 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP12AP54707 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP12AP54707 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP12AP54707 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP12AP54707 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP12AP54707 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP12AP54707 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP12AP54707 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP12AP54707 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP12AP54707 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP12AP54707 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP12AP54707 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP12AP54707 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP12AP54707 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms