Protein–RNA interactions for Protein: P52948

NUP98, Nuclear pore complex protein Nup98-Nup96, humanhuman

Predictions only

Length 1,817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP98P52948 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NUP98P52948 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NUP98P52948 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NUP98P52948 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NUP98P52948 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NUP98P52948 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NUP98P52948 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NUP98P52948 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NUP98P52948 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NUP98P52948 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
NUP98P52948 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NUP98P52948 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NUP98P52948 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NUP98P52948 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NUP98P52948 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NUP98P52948 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NUP98P52948 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NUP98P52948 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NUP98P52948 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NUP98P52948 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NUP98P52948 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NUP98P52948 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NUP98P52948 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NUP98P52948 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NUP98P52948 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
NUP98P52948 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NUP98P52948 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NUP98P52948 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NUP98P52948 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NUP98P52948 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NUP98P52948 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NUP98P52948 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NUP98P52948 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NUP98P52948 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NUP98P52948 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NUP98P52948 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NUP98P52948 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
NUP98P52948 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NUP98P52948 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NUP98P52948 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NUP98P52948 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NUP98P52948 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NUP98P52948 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
NUP98P52948 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NUP98P52948 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NUP98P52948 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NUP98P52948 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
NUP98P52948 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NUP98P52948 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NUP98P52948 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NUP98P52948 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NUP98P52948 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NUP98P52948 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NUP98P52948 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NUP98P52948 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NUP98P52948 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NUP98P52948 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NUP98P52948 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NUP98P52948 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NUP98P52948 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NUP98P52948 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NUP98P52948 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NUP98P52948 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NUP98P52948 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NUP98P52948 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NUP98P52948 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NUP98P52948 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NUP98P52948 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NUP98P52948 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NUP98P52948 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NUP98P52948 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NUP98P52948 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NUP98P52948 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NUP98P52948 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NUP98P52948 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
NUP98P52948 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NUP98P52948 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NUP98P52948 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NUP98P52948 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NUP98P52948 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NUP98P52948 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NUP98P52948 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NUP98P52948 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NUP98P52948 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NUP98P52948 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NUP98P52948 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
NUP98P52948 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NUP98P52948 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NUP98P52948 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NUP98P52948 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NUP98P52948 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
NUP98P52948 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
NUP98P52948 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
NUP98P52948 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NUP98P52948 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NUP98P52948 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NUP98P52948 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NUP98P52948 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NUP98P52948 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NUP98P52948 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms