Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC35.53■■■■□ 3.28
SMARCA2P51531 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC35.52■■■■□ 3.28
SMARCA2P51531 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC35.52■■■■□ 3.28
SMARCA2P51531 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
SMARCA2P51531 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
SMARCA2P51531 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
SMARCA2P51531 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC35.51■■■■□ 3.28
SMARCA2P51531 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC35.51■■■■□ 3.28
SMARCA2P51531 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC35.51■■■■□ 3.28
SMARCA2P51531 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC35.51■■■■□ 3.28
SMARCA2P51531 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC35.51■■■■□ 3.28
SMARCA2P51531 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
SMARCA2P51531 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.28
SMARCA2P51531 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.28
SMARCA2P51531 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
SMARCA2P51531 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC35.51■■■■□ 3.27
SMARCA2P51531 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
SMARCA2P51531 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC35.51■■■■□ 3.27
SMARCA2P51531 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
SMARCA2P51531 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.51■■■■□ 3.27
SMARCA2P51531 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC35.51■■■■□ 3.27
SMARCA2P51531 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
SMARCA2P51531 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC35.51■■■■□ 3.27
SMARCA2P51531 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC35.51■■■■□ 3.27
SMARCA2P51531 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
SMARCA2P51531 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.51■■■■□ 3.27
SMARCA2P51531 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.5■■■■□ 3.27
SMARCA2P51531 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC35.5■■■■□ 3.27
SMARCA2P51531 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
SMARCA2P51531 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC35.5■■■■□ 3.27
SMARCA2P51531 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
SMARCA2P51531 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
SMARCA2P51531 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC35.5■■■■□ 3.27
SMARCA2P51531 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC35.5■■■■□ 3.27
SMARCA2P51531 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC35.5■■■■□ 3.27
SMARCA2P51531 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC35.5■■■■□ 3.27
SMARCA2P51531 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
SMARCA2P51531 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
SMARCA2P51531 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
SMARCA2P51531 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
SMARCA2P51531 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
SMARCA2P51531 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
SMARCA2P51531 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
SMARCA2P51531 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
SMARCA2P51531 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC35.49■■■■□ 3.27
SMARCA2P51531 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC35.49■■■■□ 3.27
SMARCA2P51531 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
SMARCA2P51531 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC35.49■■■■□ 3.27
SMARCA2P51531 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
SMARCA2P51531 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
SMARCA2P51531 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
SMARCA2P51531 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
SMARCA2P51531 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC35.48■■■■□ 3.27
SMARCA2P51531 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
SMARCA2P51531 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
SMARCA2P51531 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
SMARCA2P51531 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
SMARCA2P51531 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
SMARCA2P51531 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC35.48■■■■□ 3.27
SMARCA2P51531 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC35.48■■■■□ 3.27
SMARCA2P51531 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC35.48■■■■□ 3.27
SMARCA2P51531 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
SMARCA2P51531 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.48■■■■□ 3.27
SMARCA2P51531 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
SMARCA2P51531 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
SMARCA2P51531 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
SMARCA2P51531 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
SMARCA2P51531 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
SMARCA2P51531 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.47■■■■□ 3.27
SMARCA2P51531 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC35.47■■■■□ 3.27
SMARCA2P51531 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC35.47■■■■□ 3.27
SMARCA2P51531 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC35.47■■■■□ 3.27
SMARCA2P51531 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
SMARCA2P51531 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC35.47■■■■□ 3.27
SMARCA2P51531 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
SMARCA2P51531 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
SMARCA2P51531 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
SMARCA2P51531 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC35.47■■■■□ 3.27
SMARCA2P51531 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC35.47■■■■□ 3.27
SMARCA2P51531 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC35.47■■■■□ 3.27
SMARCA2P51531 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
SMARCA2P51531 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
SMARCA2P51531 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
SMARCA2P51531 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
SMARCA2P51531 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
SMARCA2P51531 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
SMARCA2P51531 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
SMARCA2P51531 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
SMARCA2P51531 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
SMARCA2P51531 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
SMARCA2P51531 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
SMARCA2P51531 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
SMARCA2P51531 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.27
SMARCA2P51531 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
SMARCA2P51531 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
SMARCA2P51531 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC35.45■■■■□ 3.27
SMARCA2P51531 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC35.45■■■■□ 3.27
SMARCA2P51531 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC35.45■■■■□ 3.27
SMARCA2P51531 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.27
SMARCA2P51531 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms