Protein–RNA interactions for Protein: P49335

POU3F4, POU domain, class 3, transcription factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU3F4P49335 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
POU3F4P49335 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
POU3F4P49335 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
POU3F4P49335 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
POU3F4P49335 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
POU3F4P49335 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
POU3F4P49335 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
POU3F4P49335 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
POU3F4P49335 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
POU3F4P49335 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
POU3F4P49335 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
POU3F4P49335 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
POU3F4P49335 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
POU3F4P49335 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
POU3F4P49335 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
POU3F4P49335 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
POU3F4P49335 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
POU3F4P49335 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
POU3F4P49335 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
POU3F4P49335 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
POU3F4P49335 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
POU3F4P49335 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
POU3F4P49335 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
POU3F4P49335 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
POU3F4P49335 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
POU3F4P49335 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
POU3F4P49335 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
POU3F4P49335 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
POU3F4P49335 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
POU3F4P49335 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
POU3F4P49335 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
POU3F4P49335 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
POU3F4P49335 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POU3F4P49335 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POU3F4P49335 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POU3F4P49335 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POU3F4P49335 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POU3F4P49335 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POU3F4P49335 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
POU3F4P49335 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
POU3F4P49335 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POU3F4P49335 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POU3F4P49335 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POU3F4P49335 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POU3F4P49335 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
POU3F4P49335 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
POU3F4P49335 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POU3F4P49335 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
POU3F4P49335 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POU3F4P49335 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POU3F4P49335 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POU3F4P49335 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POU3F4P49335 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
POU3F4P49335 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POU3F4P49335 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
POU3F4P49335 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POU3F4P49335 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
POU3F4P49335 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POU3F4P49335 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
POU3F4P49335 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POU3F4P49335 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POU3F4P49335 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
POU3F4P49335 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POU3F4P49335 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
POU3F4P49335 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POU3F4P49335 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POU3F4P49335 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POU3F4P49335 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
POU3F4P49335 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POU3F4P49335 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
POU3F4P49335 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
POU3F4P49335 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
POU3F4P49335 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
POU3F4P49335 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
POU3F4P49335 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POU3F4P49335 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POU3F4P49335 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
POU3F4P49335 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POU3F4P49335 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POU3F4P49335 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
POU3F4P49335 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POU3F4P49335 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POU3F4P49335 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POU3F4P49335 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
POU3F4P49335 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POU3F4P49335 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
POU3F4P49335 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POU3F4P49335 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POU3F4P49335 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POU3F4P49335 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POU3F4P49335 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POU3F4P49335 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
POU3F4P49335 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POU3F4P49335 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
POU3F4P49335 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
POU3F4P49335 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
POU3F4P49335 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POU3F4P49335 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
POU3F4P49335 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POU3F4P49335 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms