Protein–RNA interactions for Protein: P46781

RPS9, 40S ribosomal protein S9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS9P46781 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPS9P46781 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPS9P46781 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPS9P46781 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPS9P46781 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPS9P46781 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPS9P46781 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPS9P46781 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPS9P46781 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPS9P46781 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPS9P46781 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPS9P46781 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPS9P46781 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPS9P46781 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPS9P46781 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPS9P46781 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPS9P46781 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPS9P46781 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
RPS9P46781 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
RPS9P46781 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPS9P46781 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPS9P46781 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
RPS9P46781 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPS9P46781 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPS9P46781 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
RPS9P46781 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPS9P46781 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPS9P46781 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPS9P46781 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPS9P46781 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPS9P46781 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
RPS9P46781 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPS9P46781 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
RPS9P46781 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPS9P46781 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPS9P46781 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPS9P46781 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPS9P46781 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPS9P46781 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPS9P46781 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPS9P46781 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPS9P46781 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPS9P46781 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPS9P46781 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPS9P46781 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPS9P46781 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPS9P46781 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPS9P46781 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPS9P46781 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPS9P46781 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPS9P46781 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPS9P46781 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPS9P46781 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPS9P46781 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPS9P46781 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPS9P46781 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPS9P46781 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPS9P46781 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPS9P46781 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPS9P46781 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPS9P46781 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPS9P46781 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPS9P46781 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPS9P46781 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPS9P46781 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPS9P46781 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
RPS9P46781 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPS9P46781 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPS9P46781 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPS9P46781 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPS9P46781 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPS9P46781 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPS9P46781 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPS9P46781 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPS9P46781 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPS9P46781 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPS9P46781 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPS9P46781 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPS9P46781 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPS9P46781 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPS9P46781 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPS9P46781 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPS9P46781 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPS9P46781 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPS9P46781 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPS9P46781 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPS9P46781 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPS9P46781 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPS9P46781 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPS9P46781 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPS9P46781 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPS9P46781 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPS9P46781 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPS9P46781 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPS9P46781 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPS9P46781 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPS9P46781 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPS9P46781 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPS9P46781 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPS9P46781 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms