Protein–RNA interactions for Protein: P46087

NOP2, Probable 28S rRNA (cytosine(4447)-C(5))-methyltransferase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP2P46087 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
NOP2P46087 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NOP2P46087 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NOP2P46087 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NOP2P46087 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
NOP2P46087 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
NOP2P46087 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
NOP2P46087 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NOP2P46087 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NOP2P46087 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NOP2P46087 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NOP2P46087 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NOP2P46087 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NOP2P46087 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC21.3■■□□□ 1
NOP2P46087 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NOP2P46087 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NOP2P46087 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NOP2P46087 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NOP2P46087 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NOP2P46087 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NOP2P46087 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NOP2P46087 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NOP2P46087 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NOP2P46087 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NOP2P46087 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NOP2P46087 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NOP2P46087 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NOP2P46087 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NOP2P46087 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NOP2P46087 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NOP2P46087 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NOP2P46087 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NOP2P46087 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
NOP2P46087 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NOP2P46087 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NOP2P46087 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NOP2P46087 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NOP2P46087 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NOP2P46087 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NOP2P46087 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NOP2P46087 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NOP2P46087 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NOP2P46087 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NOP2P46087 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NOP2P46087 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NOP2P46087 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NOP2P46087 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NOP2P46087 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NOP2P46087 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NOP2P46087 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NOP2P46087 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NOP2P46087 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NOP2P46087 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NOP2P46087 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NOP2P46087 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NOP2P46087 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NOP2P46087 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NOP2P46087 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NOP2P46087 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NOP2P46087 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
NOP2P46087 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NOP2P46087 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NOP2P46087 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NOP2P46087 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NOP2P46087 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NOP2P46087 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NOP2P46087 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NOP2P46087 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
NOP2P46087 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.28■■□□□ 1
NOP2P46087 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NOP2P46087 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NOP2P46087 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NOP2P46087 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NOP2P46087 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NOP2P46087 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NOP2P46087 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NOP2P46087 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NOP2P46087 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NOP2P46087 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
NOP2P46087 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
NOP2P46087 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.27■■□□□ 1
NOP2P46087 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
NOP2P46087 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
NOP2P46087 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NOP2P46087 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NOP2P46087 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.27■■□□□ 1
NOP2P46087 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.27■■□□□ 1
NOP2P46087 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NOP2P46087 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NOP2P46087 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NOP2P46087 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
NOP2P46087 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
NOP2P46087 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
NOP2P46087 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NOP2P46087 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NOP2P46087 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NOP2P46087 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NOP2P46087 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NOP2P46087 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NOP2P46087 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms