Protein–RNA interactions for Protein: P43694

GATA4, Transcription factor GATA-4, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA4P43694 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GATA4P43694 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GATA4P43694 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GATA4P43694 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GATA4P43694 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GATA4P43694 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GATA4P43694 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GATA4P43694 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GATA4P43694 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GATA4P43694 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GATA4P43694 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GATA4P43694 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GATA4P43694 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GATA4P43694 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GATA4P43694 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GATA4P43694 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GATA4P43694 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GATA4P43694 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GATA4P43694 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GATA4P43694 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GATA4P43694 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GATA4P43694 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GATA4P43694 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GATA4P43694 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GATA4P43694 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GATA4P43694 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GATA4P43694 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GATA4P43694 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GATA4P43694 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GATA4P43694 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GATA4P43694 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GATA4P43694 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GATA4P43694 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GATA4P43694 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GATA4P43694 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GATA4P43694 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GATA4P43694 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GATA4P43694 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GATA4P43694 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GATA4P43694 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GATA4P43694 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GATA4P43694 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GATA4P43694 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GATA4P43694 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GATA4P43694 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GATA4P43694 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GATA4P43694 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GATA4P43694 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GATA4P43694 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GATA4P43694 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GATA4P43694 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GATA4P43694 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GATA4P43694 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GATA4P43694 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GATA4P43694 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GATA4P43694 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GATA4P43694 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GATA4P43694 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GATA4P43694 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GATA4P43694 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GATA4P43694 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GATA4P43694 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GATA4P43694 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GATA4P43694 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GATA4P43694 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GATA4P43694 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GATA4P43694 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GATA4P43694 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GATA4P43694 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GATA4P43694 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GATA4P43694 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GATA4P43694 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GATA4P43694 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GATA4P43694 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GATA4P43694 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GATA4P43694 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GATA4P43694 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GATA4P43694 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GATA4P43694 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GATA4P43694 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GATA4P43694 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GATA4P43694 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GATA4P43694 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GATA4P43694 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GATA4P43694 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GATA4P43694 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GATA4P43694 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GATA4P43694 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GATA4P43694 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GATA4P43694 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GATA4P43694 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GATA4P43694 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GATA4P43694 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GATA4P43694 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GATA4P43694 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GATA4P43694 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GATA4P43694 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GATA4P43694 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GATA4P43694 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GATA4P43694 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms